Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G078100.1
Synonym EDM2, Sb08g007180
Functional annotation EDM2, putative, expressed
UniProt A0A1B6PC11
Pfam -
Panther DB PTHR22884 PTHR22884:SF340
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55390 : ENHANCED DOWNY MILDEW 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12300.1 : EDM2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G078100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G094000 expressed protein -
2 Sobic.008G054500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
4 Sobic.001G477800 expressed protein -
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7 Sobic.007G185900 IBR domain containing protein, putative, expressed K11968: ariadne-1
8 Sobic.003G422300 recA protein, expressed K03553: recombination protein RecA
9 Sobic.004G196700 expressed protein -
10 Sobic.004G031700 expressed protein -
11 Sobic.006G183800 KH domain containing protein, putative, expressed K13095: splicing factor 1
12 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G116400 - -
14 Sobic.008G129700 PAPA-1-like conserved region family protein, expressed K11666: INO80B, ZNHIT4, INO80 complex subunit B
15 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
16 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -
17 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
18 Sobic.002G157300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K15423: serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit
19 Sobic.005G149500 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
20 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic008G078100--Sobic001G094000 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic008G078100--Sobic008G054500 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic008G078100--Sobic009G040700 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic008G078100--Sobic001G477800 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic008G078100--Sobic003G187400 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic008G078100--Sobic001G544200 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic008G078100--Sobic007G185900 Sobic003G422300 Sobic003G422300 Sobic008G078100--Sobic003G422300 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic008G078100--Sobic004G196700 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic008G054500--Sobic008G173900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic008G054500--Sobic003G200200 Sobic008G054500--Sobic003G268300 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic008G054500--Sobic002G248400 Sobic008G054500--Sobic008G078100 Sobic008G054500--Sobic002G157000 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic008G054500--Sobic003G445400 Sobic008G054500--Sobic007G185900 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic008G054500--Sobic003G397800 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic008G078100 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic004G031700 Sobic001G477800--Sobic001G094000 Sobic001G477800--Sobic001G544200 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic006G080300 Sobic001G477800--Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G477800--Sobic006G009400 Sobic003G187400--Sobic002G157300 Sobic003G187400--Sobic005G149500 Sobic003G187400--Sobic009G040700 Sobic003G187400--Sobic001G094000 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic003G187400--Sobic006G173100 Sobic006G060100 Sobic006G060100 Sobic003G187400--Sobic006G060100 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic003G187400--Sobic003G401000 Sobic003G187400--Sobic004G196700 Sobic007G104800 Sobic007G104800 Sobic003G187400--Sobic007G104800 Sobic001G544200--Sobic004G031700 Sobic001G544200--Sobic001G477800 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic001G544200--Sobic001G464200 Sobic001G544200--Sobic009G040700 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic001G544200--Sobic001G511500 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic001G544200--Sobic006G128900 Sobic001G544200--Sobic008G078100 Sobic001G544200--Sobic008G054500 Sobic001G544200--Sobic001G094000 Sobic007G185900--Sobic004G196700 Sobic007G185900--Sobic002G157300 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic007G185900--Sobic007G078000 Sobic010G260500 Sobic010G260500 Sobic007G185900--Sobic010G260500 Sobic007G185900--Sobic002G313300 Sobic007G185900--Sobic008G054500 Sobic007G185900--Sobic003G397800 Sobic007G185900--Sobic005G149500 Sobic007G185900--Sobic003G187400 Sobic003G422300--Sobic003G268300 Sobic003G422300--Sobic002G248400 Sobic003G422300--Sobic006G128900 Sobic003G422300--Sobic001G094000 Sobic003G422300--Sobic002G157000 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic003G422300--Sobic001G090400 Sobic003G422300--Sobic006G060100 Sobic003G422300--Sobic001G511500 Sobic003G422300--Sobic008G078100 Sobic004G196700--Sobic007G185900 Sobic004G196700--Sobic007G078000 Sobic004G196700--Sobic005G149500 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic004G196700--Sobic007G137900 Sobic004G196700--Sobic002G157300 Sobic004G196700--Sobic003G187400 Sobic004G196700--Sobic001G477800 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic004G196700--Sobic006G082600 Sobic004G196700--Sobic009G040700
Octagon: transcription factors


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