Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G252000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PNU3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.001G228701 - -
3 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
4 Sobic.001G206100 expressed protein -
5 Sobic.010G153466 - -
6 Sobic.009G086900 expressed protein -
7 Sobic.003G170100 - -
8 Sobic.008G192500 - -
9 Sobic.001G454301 - -
10 Sobic.001G306900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K12600: SKI3, superkiller protein 3
11 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G239301 - -
13 Sobic.007G116400 - -
14 Sobic.001G303675 - -
15 Sobic.009G072333 - -
16 Sobic.001G166700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G142000 - -
18 Sobic.001G172200 - -
19 Sobic.001G356500 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
20 Sobic.002G161000 RNA recognition motif containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G252000--Sobic001G257300 Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic006G252000--Sobic001G228701 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G252000--Sobic006G013500 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G252000--Sobic001G206100 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic006G252000--Sobic010G153466 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic009G086900 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic006G252000--Sobic003G170100 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic006G252000--Sobic008G192500 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic006G252000--Sobic001G454301 Sobic001G257300--Sobic001G206100 Sobic001G257300--Sobic006G013500 Sobic001G257300--Sobic003G170100 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G257300--Sobic006G080300 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic001G257300--Sobic003G200200 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic001G257300--Sobic002G001600 Sobic004G213000 Sobic004G213000 Sobic001G257300--Sobic004G213000 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G257300--Sobic002G161000 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic001G257300--Sobic001G162300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic001G228701--Sobic002G191800 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic001G228701--Sobic002G145101 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic001G228701--Sobic002G180666 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic001G228701--Sobic001G356500 Sobic001G228701--Sobic006G252000 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic001G228701--Sobic007G103600 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic001G228701--Sobic002G264200 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic001G228701--Sobic005G207500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G228701--Sobic007G065400 Sobic006G013500--Sobic001G206100 Sobic006G013500--Sobic001G257300 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic006G080300 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G013500--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G013500--Sobic009G000500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic003G197800 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G013500--Sobic001G094000 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic006G013500--Sobic006G046700 Sobic001G206100--Sobic001G257300 Sobic001G206100--Sobic006G013500 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic006G080300 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G206100--Sobic002G157000 Sobic001G206100--Sobic009G000500 Sobic001G206100--Sobic004G213000 Sobic001G206100--Sobic001G356500 Sobic001G206100--Sobic002G161000 Sobic010G153466--Sobic001G454301 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic010G153466--Sobic009G239301 Sobic010G153466--Sobic006G252000 Sobic010G153466--Sobic006G013500 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic010G153466--Sobic007G116400 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic010G153466--Sobic006G217200 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic010G153466--Sobic002G181450 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic010G153466--Sobic002G421700 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic010G153466--Sobic009G239351 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic009G086900--Sobic008G084700 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic009G086900--Sobic010G136600 Sobic009G086900--Sobic003G170100 Sobic009G086900--Sobic001G306900 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic009G086900--Sobic001G311500 Sobic009G086900--Sobic002G180666 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic009G086900--Sobic003G445400 Sobic006G222300 Sobic006G222300 Sobic009G086900--Sobic006G222300 Sobic009G086900--Sobic002G191800 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic008G192500--Sobic003G390400 Sobic008G192500--Sobic005G110472 Sobic008G192500--Sobic006G080300 Sobic008G192500--Sobic002G145101 Sobic008G192500--Sobic003G170100 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic008G192500--Sobic008G173900 Sobic008G192500--Sobic001G257300 Sobic008G192500--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G192500--Sobic002G243900 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic006G217200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.