Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G142000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VX98
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Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.003G142000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G049700 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
2 Sobic.001G172200 - -
3 Sobic.006G252000 - -
4 Sobic.001G228701 - -
5 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
6 Sobic.003G173950 - -
7 Sobic.004G129300 chromatin modification-related protein EAF3, putative, expressed K11339: MORF4L1, MRG15, mortality factor 4-like protein 1
8 Sobic.001G356500 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
9 Sobic.001G166700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G063001 - -
11 Sobic.002G389800 expressed protein K14440: SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1
12 Sobic.009G129600 ABTB1 - Armadillo repeats with a Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed -
13 Sobic.002G051750 - -
14 Sobic.004G135900 - -
15 Sobic.005G198100 FRA10AC1, putative, expressed K13121: protein FRA10AC1
16 Sobic.003G092033 - -
17 Sobic.010G152850 - -
18 Sobic.001G206100 expressed protein -
19 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.007G026000 ATBET9, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G142000 Sobic003G142000 Sobic004G049700 Sobic004G049700 Sobic003G142000--Sobic004G049700 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic003G142000--Sobic001G172200 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic003G142000--Sobic006G252000 Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic003G142000--Sobic001G228701 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic003G142000--Sobic006G013500 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic003G142000--Sobic003G173950 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic003G142000--Sobic004G129300 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic003G142000--Sobic001G356500 Sobic001G166700 Sobic001G166700 Sobic003G142000--Sobic001G166700 Sobic001G424600 Sobic001G424600 Sobic004G049700--Sobic001G424600 Sobic002G063900 Sobic002G063900 Sobic004G049700--Sobic002G063900 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic004G049700--Sobic002G148400 Sobic006G039800 Sobic006G039800 Sobic004G049700--Sobic006G039800 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic004G049700--Sobic002G154000 Sobic006G161000 Sobic006G161000 Sobic004G049700--Sobic006G161000 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic004G049700--Sobic001G346900 Sobic001G461400 Sobic001G461400 Sobic004G049700--Sobic001G461400 Sobic007G004000 Sobic007G004000 Sobic004G049700--Sobic007G004000 Sobic001G172200--Sobic006G013500 Sobic001G172200--Sobic003G173950 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G172200--Sobic006G080300 Sobic010G152850 Sobic010G152850 Sobic001G172200--Sobic010G152850 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G172200--Sobic001G306900 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic001G172200--Sobic009G086900 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G172200--Sobic003G170100 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G172200--Sobic001G303675 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic001G172200--Sobic006G072900 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G252000--Sobic001G257300 Sobic006G252000--Sobic001G228701 Sobic006G252000--Sobic006G013500 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G252000--Sobic001G206100 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic006G252000--Sobic010G153466 Sobic006G252000--Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic003G170100 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic006G252000--Sobic008G192500 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic006G252000--Sobic001G454301 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic001G228701--Sobic002G191800 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic001G228701--Sobic002G145101 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic001G228701--Sobic002G180666 Sobic001G228701--Sobic001G356500 Sobic001G228701--Sobic006G252000 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic001G228701--Sobic007G103600 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic001G228701--Sobic002G264200 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic001G228701--Sobic005G207500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G228701--Sobic007G065400 Sobic006G013500--Sobic001G206100 Sobic006G013500--Sobic001G257300 Sobic006G013500--Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic006G080300 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G013500--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G013500--Sobic009G000500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic003G197800 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G013500--Sobic001G094000 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic006G013500--Sobic006G046700 Sobic003G173950--Sobic001G356500 Sobic003G241200 Sobic003G241200 Sobic003G173950--Sobic003G241200 Sobic003G173950--Sobic003G197800 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic003G173950--Sobic002G320500 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G173950--Sobic002G157000 Sobic003G173950--Sobic007G065400 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic003G173950--Sobic004G084300 Sobic009G102500 Sobic009G102500 Sobic003G173950--Sobic009G102500 Sobic003G173950--Sobic001G206100 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic004G129300--Sobic010G237900 Sobic007G191700 Sobic007G191700 Sobic004G129300--Sobic007G191700 Sobic001G002600 Sobic001G002600 Sobic004G129300--Sobic001G002600 Sobic007G091600 Sobic007G091600 Sobic004G129300--Sobic007G091600 Sobic007G090430 Sobic007G090430 Sobic004G129300--Sobic007G090430 Sobic008G173100 Sobic008G173100 Sobic004G129300--Sobic008G173100 Sobic001G087600 Sobic001G087600 Sobic004G129300--Sobic001G087600 Sobic007G183300 Sobic007G183300 Sobic004G129300--Sobic007G183300 Sobic001G384300 Sobic001G384300 Sobic004G129300--Sobic001G384300 Sobic001G356500--Sobic003G173950 Sobic001G356500--Sobic001G206100 Sobic001G356500--Sobic007G065400 Sobic001G356500--Sobic002G264200 Sobic001G356500--Sobic002G320500 Sobic001G356500--Sobic003G170100 Sobic002G121600 Sobic002G121600 Sobic001G356500--Sobic002G121600 Sobic001G356500--Sobic001G257300 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G356500--Sobic002G161000 Sobic001G166700--Sobic006G013500 Sobic001G166700--Sobic003G170100 Sobic001G166700--Sobic006G080300 Sobic001G166700--Sobic002G161000 Sobic001G166700--Sobic009G086900 Sobic001G166700--Sobic001G306900 Sobic001G166700--Sobic007G065400 Sobic001G166700--Sobic004G031700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G166700--Sobic003G268300
Octagon: transcription factors


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