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Transcriptome id Sobic.001G228701.1
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UniProt A0A1Z5S7A0
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G191800 - -
2 Sobic.002G145101 - -
3 Sobic.002G180666 - -
4 Sobic.001G356500 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
5 Sobic.006G252000 - -
6 Sobic.007G103600 protein of unknown function DUF1296 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G264200 RNA recognition motif containing protein, expressed -
8 Sobic.005G207500 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G065400 expressed protein K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
10 Sobic.003G059750 - K11797: PHIP, PH-interacting protein
11 Sobic.009G086900 expressed protein -
12 Sobic.003G170100 - -
13 Sobic.003G033200 F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G306900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K12600: SKI3, superkiller protein 3
15 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
16 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
17 Sobic.001G206100 expressed protein -
18 Sobic.001G461400 pre-mRNA-processing factor 39, putative, expressed K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
19 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
20 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3


Gene co-expression network
sample Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic001G228701--Sobic002G191800 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic001G228701--Sobic002G145101 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic001G228701--Sobic002G180666 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic001G228701--Sobic001G356500 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic001G228701--Sobic006G252000 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic001G228701--Sobic007G103600 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic001G228701--Sobic002G264200 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic001G228701--Sobic005G207500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G228701--Sobic007G065400 Sobic002G191800--Sobic007G065400 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G191800--Sobic003G372700 Sobic002G191800--Sobic002G180666 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic002G191800--Sobic002G006900 Sobic010G201500 Sobic010G201500 Sobic002G191800--Sobic010G201500 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic002G191800--Sobic001G241200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic002G191800--Sobic007G096600 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic002G191800--Sobic010G277500 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic002G191800--Sobic003G119000 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic002G180666--Sobic003G148000 Sobic002G180666--Sobic006G032500 Sobic002G180666--Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic006G048500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic004G007100 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic002G180666--Sobic007G161300 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic002G180666--Sobic001G456900 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic001G356500--Sobic003G173950 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic001G356500--Sobic001G206100 Sobic001G356500--Sobic007G065400 Sobic001G356500--Sobic002G264200 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G356500--Sobic002G320500 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G356500--Sobic003G170100 Sobic002G121600 Sobic002G121600 Sobic001G356500--Sobic002G121600 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic001G356500--Sobic001G257300 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G356500--Sobic002G161000 Sobic006G252000--Sobic001G257300 Sobic006G252000--Sobic001G228701 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G252000--Sobic006G013500 Sobic006G252000--Sobic001G206100 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic006G252000--Sobic010G153466 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic009G086900 Sobic006G252000--Sobic003G170100 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic006G252000--Sobic008G192500 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic006G252000--Sobic001G454301 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic007G103600--Sobic003G059750 Sobic007G103600--Sobic005G207500 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic007G103600--Sobic005G118600 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic007G103600--Sobic003G444800 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic007G103600--Sobic002G071500 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic007G103600--Sobic008G153000 Sobic007G103600--Sobic003G119000 Sobic007G103600--Sobic002G264200 Sobic007G103600--Sobic006G032500 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic002G264200--Sobic010G069100 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic002G264200--Sobic003G416700 Sobic001G461400 Sobic001G461400 Sobic002G264200--Sobic001G461400 Sobic002G264200--Sobic008G153000 Sobic010G236400 Sobic010G236400 Sobic002G264200--Sobic010G236400 Sobic002G264200--Sobic002G071500 Sobic002G264200--Sobic007G065400 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic002G264200--Sobic002G153700 Sobic006G118700 Sobic006G118700 Sobic002G264200--Sobic006G118700 Sobic005G207500--Sobic003G059750 Sobic005G207500--Sobic002G153700 Sobic005G207500--Sobic007G103600 Sobic005G207500--Sobic003G119000 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic005G207500--Sobic008G009700 Sobic002G353600 Sobic002G353600 Sobic005G207500--Sobic002G353600 Sobic005G207500--Sobic010G069100 Sobic005G207500--Sobic002G071500 Sobic001G026200 Sobic001G026200 Sobic005G207500--Sobic001G026200 Sobic007G065400--Sobic002G006900 Sobic007G065400--Sobic002G191800 Sobic007G065400--Sobic008G009700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic007G065400--Sobic009G040600 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic007G065400--Sobic004G145500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic007G065400--Sobic009G210500 Sobic007G065400--Sobic003G119000 Sobic007G065400--Sobic003G372700 Sobic007G065400--Sobic008G028700
Octagon: transcription factors


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