Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G033200.1
Synonym Sb03g003020
Functional annotation F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q124
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G29420 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g09740.1 : F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023027
Brachypodium KQK03140
Barley -
Wheat TraesCS3D02G108300 , TraesCS3A02G106200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
2 Sobic.001G456900 expressed protein -
3 Sobic.001G384300 myb-like DNA-binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G145101 - -
5 Sobic.001G356500 polypyrimidine tract-binding protein, putative, expressed K14948: PTBP2, polypyrimidine tract-binding protein 2
6 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
7 Sobic.008G162900 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
8 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G228701 - -
10 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G173100 actin, putative, expressed K11662: ACTR6, actin-related protein 6
12 Sobic.008G092532 - -
13 Sobic.009G086900 expressed protein -
14 Sobic.002G103600 glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed K03857: PIGA, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit A
15 Sobic.001G227200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K00861: RFK, riboflavin kinase
16 Sobic.002G180666 - -
17 Sobic.007G090430 - -
18 Sobic.004G040350 - -
19 Sobic.003G217900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.002G343901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G033200 Sobic003G033200 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic003G033200--Sobic001G311500 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic003G033200--Sobic001G456900 Sobic001G384300 Sobic001G384300 Sobic003G033200--Sobic001G384300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic003G033200--Sobic002G145101 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic003G033200--Sobic001G356500 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G033200--Sobic004G258700 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic003G033200--Sobic008G162900 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic003G033200--Sobic005G013200 Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic003G033200--Sobic001G228701 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic001G311500--Sobic010G139000 Sobic009G247400 Sobic009G247400 Sobic001G311500--Sobic009G247400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic001G311500--Sobic005G112300 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic001G311500--Sobic003G059750 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic001G311500--Sobic008G009700 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic001G311500--Sobic004G314000 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic001G311500--Sobic010G279450 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic001G311500--Sobic008G028700 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic001G311500--Sobic001G363500 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic010G139000 Sobic001G456900--Sobic004G258700 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic001G456900--Sobic008G113100 Sobic001G456900--Sobic008G028700 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic001G456900--Sobic002G180666 Sobic001G456900--Sobic001G311500 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic001G456900--Sobic003G398700 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic001G456900--Sobic003G101500 Sobic007G090430 Sobic007G090430 Sobic001G384300--Sobic007G090430 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic001G384300--Sobic006G096900 Sobic002G083500 Sobic002G083500 Sobic001G384300--Sobic002G083500 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic001G384300--Sobic001G227200 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic001G384300--Sobic002G343901 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G384300--Sobic001G433800 Sobic001G384300--Sobic001G456900 Sobic001G384300--Sobic008G113100 Sobic001G384300--Sobic008G162900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic001G356500--Sobic003G173950 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic001G356500--Sobic001G206100 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G356500--Sobic007G065400 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic001G356500--Sobic002G264200 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G356500--Sobic002G320500 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G356500--Sobic003G170100 Sobic002G121600 Sobic002G121600 Sobic001G356500--Sobic002G121600 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic001G356500--Sobic001G257300 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G356500--Sobic002G161000 Sobic004G258700--Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G028700 Sobic004G258700--Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic003G148000 Sobic004G258700--Sobic003G101500 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic004G258700--Sobic010G277500 Sobic004G258700--Sobic007G065400 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic004G258700--Sobic007G161000 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G258700--Sobic009G040600 Sobic003G184699 Sobic003G184699 Sobic008G162900--Sobic003G184699 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic008G162900--Sobic009G126400 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic008G162900--Sobic008G047800 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic008G162900--Sobic001G407200 Sobic008G162900--Sobic005G013200 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic008G162900--Sobic003G052200 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic008G162900--Sobic006G216800 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic008G162900--Sobic001G222500 Sobic008G162900--Sobic002G343901 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic002G103600 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic005G013200--Sobic010G129200 Sobic005G013200--Sobic008G162900 Sobic005G013200--Sobic001G407200 Sobic005G013200--Sobic001G222500 Sobic002G408200 Sobic002G408200 Sobic005G013200--Sobic002G408200 Sobic005G013200--Sobic008G028700 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic005G013200--Sobic001G251700 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic005G013200--Sobic004G084300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic001G228701--Sobic002G191800 Sobic001G228701--Sobic002G145101 Sobic001G228701--Sobic002G180666 Sobic001G228701--Sobic001G356500 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic001G228701--Sobic006G252000 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic001G228701--Sobic007G103600 Sobic001G228701--Sobic002G264200 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic001G228701--Sobic005G207500 Sobic001G228701--Sobic007G065400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.