Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G217900.2
Synonym Sb03g027670
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5XQZ3
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF173
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03610 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55660.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5D02G443200 , TraesCS5B02G438700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G217900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G159900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
2 Sobic.001G456900 expressed protein -
3 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
5 Sobic.001G036050 - -
6 Sobic.003G033200 F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G040350 - -
8 Sobic.009G083500 - -
9 Sobic.003G170900 - -
10 Sobic.007G110700 serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed K08827: serine/threonine-protein kinase PRP4
11 Sobic.002G148750 - -
12 Sobic.008G092532 - -
13 Sobic.002G180666 - -
14 Sobic.007G161300 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G139000 surp module family protein, putative, expressed K13123: G patch domain-containing protein 1
16 Sobic.003G188400 glutamate dehydrogenase protein, putative, expressed K00262: E1.4.1.4, glutamate dehydrogenase (NADP+)
17 Sobic.005G064000 SWIRM domain containing protein, expressed K11649: SWI/SNF related-matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C
18 Sobic.001G063700 expressed protein -
19 Sobic.001G228701 - -
20 Sobic.004G088200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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