Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G161300.1
Synonym
Functional annotation VHS and GAT domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PIC9
Pfam -
Panther DB PTHR13856 PTHR13856:SF85
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01760 : ENTH/VHS/GAT family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61030.1 : VHS and GAT domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G180666 - -
2 Sobic.006G032500 - -
3 Sobic.004G007100 - -
4 Sobic.006G048500 - -
5 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G372700 expressed protein -
7 Sobic.004G039700 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
9 Sobic.001G456900 expressed protein -
10 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
11 Sobic.004G040350 - -
12 Sobic.008G084700 - -
13 Sobic.003G087400 - -
14 Sobic.001G205200 expressed protein -
15 Sobic.002G145101 - -
16 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G059750 - K11797: PHIP, PH-interacting protein
18 Sobic.010G139000 surp module family protein, putative, expressed K13123: G patch domain-containing protein 1
19 Sobic.002G243900 - -
20 Sobic.008G162900 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2


Gene co-expression network
sample Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic007G161300--Sobic002G180666 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic007G161300--Sobic006G032500 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G161300--Sobic004G007100 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic007G161300--Sobic006G048500 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic007G161300--Sobic008G028700 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic007G161300--Sobic003G372700 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic007G161300--Sobic004G039700 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G161300--Sobic003G148000 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic007G161300--Sobic001G456900 Sobic002G180666--Sobic003G148000 Sobic002G180666--Sobic006G032500 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic006G048500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic004G007100 Sobic002G180666--Sobic007G161300 Sobic002G180666--Sobic001G456900 Sobic006G032500--Sobic002G180666 Sobic006G032500--Sobic003G372700 Sobic006G032500--Sobic003G148000 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic002G145101 Sobic006G032500--Sobic007G161300 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G032500--Sobic005G112300 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G032500--Sobic010G139000 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic006G032500--Sobic008G084700 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic010G279450 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic008G028700--Sobic009G040600 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G009600 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic008G028700--Sobic004G258700 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic008G028700--Sobic007G065400 Sobic008G028700--Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G145101 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic008G028700--Sobic008G113100 Sobic003G372700--Sobic002G006900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic007G065400 Sobic003G372700--Sobic005G112300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic009G040600 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G372700--Sobic002G309600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G372700--Sobic001G474600 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic004G039700--Sobic007G096000 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic004G039700--Sobic004G208900 Sobic004G039700--Sobic003G280800 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic004G039700--Sobic008G162900 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic004G039700--Sobic010G277500 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic004G039700--Sobic003G176500 Sobic004G039700--Sobic007G161300 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic004G039700--Sobic003G052200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic004G039700--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic001G036050 Sobic001G456900--Sobic010G139000 Sobic001G456900--Sobic004G258700 Sobic001G456900--Sobic008G113100 Sobic001G456900--Sobic008G028700 Sobic001G456900--Sobic002G180666 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic001G456900--Sobic001G311500 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic001G456900--Sobic003G398700 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic001G456900--Sobic003G101500
Octagon: transcription factors


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