Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G205200.1
Synonym SFR6, Sb01g018130
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WX98
Pfam -
Panther DB PTHR35130 PTHR35130:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G04920 : sensitive to freezing 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006452
Brachypodium KQJ97301 , KQJ97302
Barley HORVU1Hr1G044810.8 , HORVU1Hr1G044810.9 , HORVU1Hr1G044810.1 , HORVU1Hr1G044810.2 , HORVU1Hr1G044810.3 , HORVU1Hr1G044810.4 , HORVU1Hr1G044810.5 , HORVU1Hr1G044810.6 , HORVU1Hr1G044810.7 , HORVU1Hr1G044810.12 , HORVU1Hr1G044810.13 , HORVU1Hr1G044810.10 , HORVU1Hr1G044810.11
Wheat TraesCS1D02G168100 , TraesCS1A02G170400 , TraesCS1A02G170400 , TraesCS1A02G170400 , TraesCS1B02G187100 , TraesCS1B02G187100 , TraesCS1B02G187100
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cDNA sequences
Sobic.001G205200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.001G155000 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, putative, expressed K03010: RPB2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
18 Sobic.005G144400 - -
19 Sobic.008G047800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K15361: WDR48, WD repeat-containing protein 48
20 Sobic.007G161300 VHS and GAT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic001G205200--Sobic006G048500 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic001G205200--Sobic002G006900 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic001G205200--Sobic003G372700 Sobic002G297200 Sobic002G297200 Sobic001G205200--Sobic002G297200 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic001G205200--Sobic004G007100 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic001G205200--Sobic002G309600 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic001G205200--Sobic003G087400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic001G205200--Sobic007G167500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G205200--Sobic003G029700 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G006900--Sobic008G047800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic002G006900--Sobic007G065400 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G372700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic002G006900--Sobic009G040600 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic002G309600 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G006900--Sobic001G214300 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic002G006900--Sobic001G512700 Sobic003G372700--Sobic002G006900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic007G065400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G372700--Sobic005G112300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic009G040600 Sobic003G372700--Sobic002G309600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G372700--Sobic001G474600 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic002G297200--Sobic003G397800 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic002G297200--Sobic010G101800 Sobic002G297200--Sobic001G512700 Sobic004G146500 Sobic004G146500 Sobic002G297200--Sobic004G146500 Sobic002G297200--Sobic008G047800 Sobic001G109800 Sobic001G109800 Sobic002G297200--Sobic001G109800 Sobic002G297200--Sobic001G155000 Sobic002G297200--Sobic001G205200 Sobic002G297200--Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic002G309600--Sobic003G280800 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic002G309600--Sobic002G134200 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic002G309600--Sobic007G117400 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic002G309600--Sobic008G009700 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic002G309600--Sobic001G071400 Sobic002G309600--Sobic005G112300 Sobic004G065100 Sobic004G065100 Sobic002G309600--Sobic004G065100 Sobic001G154900 Sobic001G154900 Sobic002G309600--Sobic001G154900 Sobic002G309600--Sobic002G006900 Sobic003G087400--Sobic007G178700 Sobic003G087400--Sobic004G007100 Sobic003G087400--Sobic009G104201 Sobic003G087400--Sobic006G048500 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G087400--Sobic009G127900 Sobic003G087400--Sobic002G006900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G087400--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic001G205200 Sobic007G167500--Sobic003G119000 Sobic007G167500--Sobic002G006900 Sobic007G167500--Sobic003G397800 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic007G167500--Sobic007G096600 Sobic007G167500--Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic007G065400 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic007G167500--Sobic009G210500 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G372700 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic003G029700--Sobic004G341900 Sobic003G029700--Sobic001G214300 Sobic010G013800 Sobic010G013800 Sobic003G029700--Sobic010G013800 Sobic003G029700--Sobic008G047800 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic001G497300 Sobic003G029700--Sobic002G006900 Sobic009G026500 Sobic009G026500 Sobic003G029700--Sobic009G026500 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic003G029700--Sobic009G191000 Sobic003G029700--Sobic001G205200
Octagon: transcription factors


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