Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G397800.2,Sobic.003G397800.1
Synonym Sb03g043450
Functional annotation -
UniProt C5XFL3 , A0A1W0W126
Pfam PF00271 PF00270
Panther DB PTHR24031 PTHR24031:SF269
NCBI CDD -
KEGG Orthology K12823; DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G63120 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68320.3,LOC_Os01g68320.1 : DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 30, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026331 , Zm00025a005690
Brachypodium PNT73434 , KQK11137 , KQK11136
Barley HORVU3Hr1G092610.3 , HORVU3Hr1G092610.2 , HORVU3Hr1G092610.1 , HORVU3Hr1G092600.4 , HORVU3Hr1G092600.5 , HORVU3Hr1G092600.1 , HORVU3Hr1G092600.2 , HORVU3Hr1G092600.3
Wheat TraesCS3A02G416900 , TraesCS3B02G451900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G081000 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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