Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G353600.3,Sobic.002G353600.1,Sobic.002G353600.2
Synonym Sb02g037540
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XCF9 , A0A1W0W6W1 , A0A1B6QF65
Pfam PF13320
Panther DB PTHR37193 PTHR37193:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G45150 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39300.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054830 , Zm00025a015002
Brachypodium KQK15528 , KQK15526 , KQK15527
Barley HORVU2Hr1G036750.24 , HORVU2Hr1G036750.25 , HORVU2Hr1G036750.26 , HORVU2Hr1G036750.27 , HORVU2Hr1G036750.20 , HORVU2Hr1G036750.21 , HORVU2Hr1G036750.22 , HORVU2Hr1G036750.23 , HORVU2Hr1G036750.28 , HORVU2Hr1G036750.29 , HORVU2Hr1G036750.15 , HORVU2Hr1G036750.19 , HORVU2Hr1G036750.18 , HORVU2Hr1G036750.11 , HORVU2Hr1G036750.10 , HORVU2Hr1G036750.13 , HORVU2Hr1G036750.12 , HORVU2Hr1G036750.14 , HORVU2Hr1G036750.17 , HORVU2Hr1G036750.16 , HORVU2Hr1G036750.9 , HORVU2Hr1G036750.8 , HORVU2Hr1G036750.5 , HORVU2Hr1G036750.4 , HORVU2Hr1G036750.7 , HORVU2Hr1G036750.6 , HORVU2Hr1G036750.3
Wheat TraesCS2D02G199400 , TraesCS2D02G199400 , TraesCS2D02G199400 , TraesCS2D02G199400 , TraesCS2D02G199400 , TraesCS2D02G199400 , TraesCS2A02G188200 , TraesCS2A02G188200 , TraesCS2B02G219000 , TraesCS2B02G219000
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cDNA sequences
Sobic.002G353600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G397800 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
2 Sobic.007G146900 ARID/BRIGHT DNA-binding domain containing protein, expressed -
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9 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -
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11 Sobic.008G153000 MATH domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G167500 expressed protein -
13 Sobic.004G271000 expressed protein -
14 Sobic.002G153700 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
15 Sobic.007G026000 ATBET9, putative, expressed -
16 Sobic.007G103600 protein of unknown function DUF1296 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G119000 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
18 Sobic.001G109800 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C member, putative, expressed K11649: SWI/SNF related-matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily C
19 Sobic.001G517500 Ubiquitin family domain containing protein, expressed K04523: UBQLN, ubiquilin
20 Sobic.009G026500 ATSIZ1/SIZ1, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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