Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G086900.9,Sobic.009G086900.11,Sobic.009G086900.17,Sobic.009G086900.3,Sobic.009G086900.7,Sobic.009G086900.8,Sobic.009G086900.6,Sobic.009G086900.13,Sobic.009G086900.5,Sobic.009G086900.18,Sobic.009G086900.15,Sobic.009G086900.12,Sobic.009G086900.16,Sobic.009G086900.2,Sobic.009G086900.10,Sobic.009G086900.14,Sobic.009G086900.1,Sobic.009G086900.4
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R1M8 , A0A1Z5R1L3 , A0A1Z5R1R2 , A0A1Z5R2K9 , A0A1Z5R1M1 , A0A1B6P7T1 , A0A1B6P7G3 , A0A1Z5R1L0 , A0A1Z5R1N1 , A0A1Z5R2C0 , A0A1Z5R2T4 , A0A1Z5R1Q4 , A0A1Z5R1M4
Pfam -
Panther DB PTHR36401
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47570 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g40410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003289 , Zm00025a052005
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G084700 - -
2 Sobic.010G136600 - -
3 Sobic.003G170100 - -
4 Sobic.001G306900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K12600: SKI3, superkiller protein 3
5 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
6 Sobic.002G180666 - -
7 Sobic.003G445400 vacuolar fusion protein MON1 homolog A, putative, expressed -
8 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.002G191800 - -
10 Sobic.002G264200 RNA recognition motif containing protein, expressed -
11 Sobic.003G307000 RNA recognition motif containing protein, expressed K18667: activating signal cointegrator complex subunit 2
12 Sobic.006G116100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G084900 expressed protein -
15 Sobic.007G096600 - -
16 Sobic.002G145101 - -
17 Sobic.007G065400 expressed protein K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
18 Sobic.001G167200 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03511: DNA polymerase kappa
19 Sobic.009G102500 - -
20 Sobic.010G152850 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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