Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G135900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPK6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G063001 - -
2 Sobic.003G256600 - -
3 Sobic.002G162500 - -
4 Sobic.003G142000 - -
5 Sobic.009G239301 - -
6 Sobic.010G172000 - -
7 Sobic.006G274100 ribosome biogenesis regulatory protein, putative, expressed K14852: regulator of ribosome biosynthesis
8 Sobic.009G107080 - -
9 Sobic.001G346900 RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed K14292: trimethylguanosine synthase
10 Sobic.003G127500 expressed protein -
11 Sobic.001G018100 "qTGW3/GL3.3/TGW3(Ortholog in rice:Hu et al., 2018/Xia et al., 2018/Ying et al., 2018 )"(PubMedID : 31659830)@CGMC_GSK.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K03083: glycogen synthase kinase 3 beta
12 Sobic.006G067600 histone deacetylase, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
13 Sobic.004G049700 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
14 Sobic.001G482200 FAR1 family protein, expressed K17604: zinc finger SWIM domain-containing protein 3
15 Sobic.005G114400 TBC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G148400 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific ATX1, putative, expressed -
17 Sobic.002G177500 expressed protein -
18 Sobic.001G172200 - -
19 Sobic.001G146600 - -
20 Sobic.004G355800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic004G135900--Sobic006G063001 Sobic003G256600 Sobic003G256600 Sobic004G135900--Sobic003G256600 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic004G135900--Sobic002G162500 Sobic003G142000 Sobic003G142000 Sobic004G135900--Sobic003G142000 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic004G135900--Sobic009G239301 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic004G135900--Sobic010G172000 Sobic006G274100 Sobic006G274100 Sobic004G135900--Sobic006G274100 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic004G135900--Sobic009G107080 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic004G135900--Sobic001G346900 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic006G063001--Sobic007G225800 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic006G063001--Sobic008G092532 Sobic006G063001--Sobic004G135900 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic010G172000 Sobic006G063001--Sobic003G142000 Sobic002G424900 Sobic002G424900 Sobic006G063001--Sobic002G424900 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic006G063001--Sobic001G258900 Sobic006G063001--Sobic002G162500 Sobic003G256600--Sobic004G135900 Sobic003G256600--Sobic006G063001 Sobic002G031500 Sobic002G031500 Sobic003G256600--Sobic002G031500 Sobic003G256600--Sobic002G162500 Sobic003G256600--Sobic009G107080 Sobic001G503200 Sobic001G503200 Sobic003G256600--Sobic001G503200 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic003G256600--Sobic003G032600 Sobic010G060166 Sobic010G060166 Sobic003G256600--Sobic010G060166 Sobic003G256600--Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic004G049700 Sobic004G049700 Sobic003G142000--Sobic004G049700 Sobic003G142000--Sobic001G172200 Sobic006G252000 Sobic006G252000 Sobic003G142000--Sobic006G252000 Sobic001G228701 Sobic001G228701 Sobic003G142000--Sobic001G228701 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic003G142000--Sobic006G013500 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic003G142000--Sobic003G173950 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic003G142000--Sobic004G129300 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic003G142000--Sobic001G356500 Sobic001G166700 Sobic001G166700 Sobic003G142000--Sobic001G166700 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic009G239301--Sobic009G239351 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G239301--Sobic001G454301 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic009G239301--Sobic010G153466 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic007G046900 Sobic009G239301--Sobic006G252000 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic009G239301--Sobic006G210200 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G239301--Sobic007G116400 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic009G239301--Sobic006G217200 Sobic009G239301--Sobic006G013500 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic010G172000--Sobic007G054400 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G172000--Sobic004G258700 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic001G253200 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic010G172000--Sobic003G101500 Sobic008G101900 Sobic008G101900 Sobic006G274100--Sobic008G101900 Sobic006G140400 Sobic006G140400 Sobic006G274100--Sobic006G140400 Sobic010G032300 Sobic010G032300 Sobic006G274100--Sobic010G032300 Sobic002G380100 Sobic002G380100 Sobic006G274100--Sobic002G380100 Sobic004G354000 Sobic004G354000 Sobic006G274100--Sobic004G354000 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic006G274100--Sobic004G119400 Sobic004G027400 Sobic004G027400 Sobic006G274100--Sobic004G027400 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic006G274100--Sobic003G259600 Sobic009G066400 Sobic009G066400 Sobic006G274100--Sobic009G066400 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G258900 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G162500 Sobic009G107080--Sobic004G135900 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic006G063001 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic002G340200 Sobic004G086200 Sobic004G086200 Sobic001G346900--Sobic004G086200 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic001G346900--Sobic003G409200 Sobic001G134300 Sobic001G134300 Sobic001G346900--Sobic001G134300 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic001G346900--Sobic003G042400 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic001G346900--Sobic008G147200 Sobic004G285000 Sobic004G285000 Sobic001G346900--Sobic004G285000 Sobic003G416700 Sobic003G416700 Sobic001G346900--Sobic003G416700 Sobic010G096000 Sobic010G096000 Sobic001G346900--Sobic010G096000 Sobic002G422100 Sobic002G422100 Sobic001G346900--Sobic002G422100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.