Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G146600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QIZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G172000 - -
2 Sobic.006G274100 ribosome biogenesis regulatory protein, putative, expressed K14852: regulator of ribosome biosynthesis
3 Sobic.002G425200 expressed protein -
4 Sobic.006G118300 vacuolar sorting protein 9 domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G420300 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G135900 - -
7 Sobic.009G018450 - -
8 Sobic.003G383700 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G127500 expressed protein -
10 Sobic.007G070000 polyprenyl synthetase, putative, expressed K14066: geranyl diphosphate synthase
11 Sobic.003G341700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G063001 - -
13 Sobic.001G258900 - -
14 Sobic.008G045000 expressed protein -
15 Sobic.003G096300 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
16 Sobic.009G066400 MAR-binding filament-like protein 1, putative, expressed -
17 Sobic.002G162500 - -
18 Sobic.008G101900 plastid division regulator MinE, putative, expressed -
19 Sobic.001G300900 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.009G148200 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G146600 Sobic001G146600 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic001G146600--Sobic010G172000 Sobic006G274100 Sobic006G274100 Sobic001G146600--Sobic006G274100 Sobic002G425200 Sobic002G425200 Sobic001G146600--Sobic002G425200 Sobic006G118300 Sobic006G118300 Sobic001G146600--Sobic006G118300 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic001G146600--Sobic002G420300 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic001G146600--Sobic004G135900 Sobic009G018450 Sobic009G018450 Sobic001G146600--Sobic009G018450 Sobic003G383700 Sobic003G383700 Sobic001G146600--Sobic003G383700 Sobic003G127500 Sobic003G127500 Sobic001G146600--Sobic003G127500 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic007G054400 Sobic007G054400 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Octagon: transcription factors


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