Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G425200.1
Synonym Sb02g043590
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X5Q4
Pfam -
Panther DB PTHR13140 PTHR13140:SF164
NCBI CDD KOG4593; Mitotic checkpoint protein MAD1
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39300 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g48700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015480 , Zm00025a053024
Brachypodium KQK14564
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G177000 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
2 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
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9 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -
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12 Sobic.002G203500 protein binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G300000 - -
14 Sobic.001G146301 - -
15 Sobic.003G096300 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
16 Sobic.003G104100 expressed protein -
17 Sobic.003G135500 sugar transporter superfamily, putative, expressed -
18 Sobic.009G148200 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed -
19 Sobic.007G161600 SET domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G098500 H-BTB6 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G425200 Sobic002G425200 Sobic003G177000 Sobic003G177000 Sobic002G425200--Sobic003G177000 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic002G425200--Sobic007G159200 Sobic008G038200 Sobic008G038200 Sobic002G425200--Sobic008G038200 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G425200--Sobic008G088842 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic002G425200--Sobic006G280100 Sobic004G199200 Sobic004G199200 Sobic002G425200--Sobic004G199200 Sobic006G067700 Sobic006G067700 Sobic002G425200--Sobic006G067700 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic002G425200--Sobic008G080500 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic002G425200--Sobic006G112700 Sobic003G177000--Sobic002G425200 Sobic003G177000--Sobic008G038200 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic003G177000--Sobic001G300000 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic003G177000--Sobic001G541000 Sobic007G161600 Sobic007G161600 Sobic003G177000--Sobic007G161600 Sobic003G177000--Sobic006G280100 Sobic001G523700 Sobic001G523700 Sobic003G177000--Sobic001G523700 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Octagon: transcription factors


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