Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G135500.1
Synonym Sb03g011520
Functional annotation sugar transporter superfamily, putative, expressed
UniProt C5XHE3
Pfam -
Panther DB PTHR33604
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G12260 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g18060.1 : sugar transporter superfamily, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024203
Brachypodium PNT70366 , PNT70367 , KQK03978 , KQK03977
Barley -
Wheat TraesCS3B02G208000 , TraesCS3A02G177000 , TraesCS3D02G183600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G280100 SET domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G431600 expressed protein -
3 Sobic.003G299500 expressed protein -
4 Sobic.006G181800 gamma-tubulin complex component 6, putative, expressed K16573: TUBGCP6, gamma-tubulin complex component 6
5 Sobic.009G120400 methyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.003G360300 exostosin family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G080500 expressed protein -
8 Sobic.008G092800 expressed protein -
9 Sobic.002G079100 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
10 Sobic.002G426100 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed -
11 Sobic.003G016500 histone-lysine N-methyltransferase ATX5, putative, expressed -
12 Sobic.007G047600 expressed protein -
13 Sobic.001G300000 - -
14 Sobic.006G236000 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K16252: NRPD2, DNA-directed RNA polymerase IV and V subunit 2
15 Sobic.001G537400 MYB family transcription factor, putative, expressed -
16 Sobic.002G112600 zinc finger family protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G111600 heat shock protein, putative, expressed K09487: HSP90B, heat shock protein 90kDa beta
18 Sobic.002G043000 HEN1, putative, expressed -
19 Sobic.003G250900 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G262100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic003G135500--Sobic006G280100 Sobic003G431600 Sobic003G431600 Sobic003G135500--Sobic003G431600 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic003G135500--Sobic003G299500 Sobic006G181800 Sobic006G181800 Sobic003G135500--Sobic006G181800 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G135500--Sobic009G120400 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic003G135500--Sobic003G360300 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic003G135500--Sobic008G080500 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic003G135500--Sobic008G092800 Sobic002G079100 Sobic002G079100 Sobic003G135500--Sobic002G079100 Sobic009G190200 Sobic009G190200 Sobic006G280100--Sobic009G190200 Sobic002G219900 Sobic002G219900 Sobic006G280100--Sobic002G219900 Sobic004G043750 Sobic004G043750 Sobic006G280100--Sobic004G043750 Sobic004G038100 Sobic004G038100 Sobic006G280100--Sobic004G038100 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic006G280100--Sobic007G159200 Sobic006G280100--Sobic003G135500 Sobic007G125700 Sobic007G125700 Sobic006G280100--Sobic007G125700 Sobic006G280100--Sobic002G079100 Sobic006G280100--Sobic008G080500 Sobic003G431600--Sobic003G135500 Sobic001G203500 Sobic001G203500 Sobic003G431600--Sobic001G203500 Sobic003G431600--Sobic008G092800 Sobic003G431600--Sobic006G181800 Sobic003G250900 Sobic003G250900 Sobic003G431600--Sobic003G250900 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic003G431600--Sobic001G300000 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic003G431600--Sobic001G541000 Sobic002G426100 Sobic002G426100 Sobic003G431600--Sobic002G426100 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic003G431600--Sobic006G265600 Sobic007G034200 Sobic007G034200 Sobic003G299500--Sobic007G034200 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic003G299500--Sobic003G194800 Sobic004G106250 Sobic004G106250 Sobic003G299500--Sobic004G106250 Sobic003G299500--Sobic009G120400 Sobic003G016500 Sobic003G016500 Sobic003G299500--Sobic003G016500 Sobic001G123600 Sobic001G123600 Sobic003G299500--Sobic001G123600 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic003G299500--Sobic006G245900 Sobic002G235900 Sobic002G235900 Sobic003G299500--Sobic002G235900 Sobic006G191200 Sobic006G191200 Sobic003G299500--Sobic006G191200 Sobic008G111600 Sobic008G111600 Sobic006G181800--Sobic008G111600 Sobic006G181800--Sobic004G038100 Sobic006G181800--Sobic002G426100 Sobic006G033101 Sobic006G033101 Sobic006G181800--Sobic006G033101 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic006G181800--Sobic002G371600 Sobic002G043000 Sobic002G043000 Sobic006G181800--Sobic002G043000 Sobic006G181800--Sobic008G092800 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic006G181800--Sobic006G236000 Sobic010G188000 Sobic010G188000 Sobic006G181800--Sobic010G188000 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic009G120400--Sobic002G173400 Sobic009G120400--Sobic002G426100 Sobic009G120400--Sobic007G034200 Sobic009G120400--Sobic003G194800 Sobic004G215600 Sobic004G215600 Sobic009G120400--Sobic004G215600 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic009G120400--Sobic007G105700 Sobic009G120400--Sobic003G299500 Sobic007G186400 Sobic007G186400 Sobic009G120400--Sobic007G186400 Sobic001G051400 Sobic001G051400 Sobic009G120400--Sobic001G051400 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic003G360300--Sobic003G259600 Sobic003G360300--Sobic001G123600 Sobic010G269300 Sobic010G269300 Sobic003G360300--Sobic010G269300 Sobic007G047600 Sobic007G047600 Sobic003G360300--Sobic007G047600 Sobic006G179300 Sobic006G179300 Sobic003G360300--Sobic006G179300 Sobic002G142700 Sobic002G142700 Sobic003G360300--Sobic002G142700 Sobic004G342300 Sobic004G342300 Sobic003G360300--Sobic004G342300 Sobic004G277400 Sobic004G277400 Sobic003G360300--Sobic004G277400 Sobic003G360300--Sobic008G080500 Sobic008G080500--Sobic007G159200 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic008G080500--Sobic010G262100 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic008G080500--Sobic004G355800 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic008G080500--Sobic006G112700 Sobic008G080500--Sobic002G079100 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic008G080500--Sobic005G200900 Sobic008G080500--Sobic010G269300 Sobic008G080500--Sobic003G299500 Sobic008G080500--Sobic002G235900 Sobic003G143800 Sobic003G143800 Sobic008G092800--Sobic003G143800 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic008G092800--Sobic007G145400 Sobic008G092800--Sobic003G016500 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic008G092800--Sobic001G248100 Sobic008G092800--Sobic010G262100 Sobic001G437400 Sobic001G437400 Sobic008G092800--Sobic001G437400 Sobic008G092800--Sobic007G047600 Sobic008G092800--Sobic006G181800 Sobic008G092800--Sobic002G371600 Sobic003G124600 Sobic003G124600 Sobic002G079100--Sobic003G124600 Sobic001G448100 Sobic001G448100 Sobic002G079100--Sobic001G448100 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic002G079100--Sobic008G017100 Sobic002G079100--Sobic008G080500 Sobic002G380100 Sobic002G380100 Sobic002G079100--Sobic002G380100 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic002G079100--Sobic002G292800 Sobic010G278600 Sobic010G278600 Sobic002G079100--Sobic010G278600 Sobic002G079100--Sobic006G245900 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic002G079100--Sobic001G482200
Octagon: transcription factors


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