Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G047600.4,Sobic.007G047600.1,Sobic.007G047600.2,Sobic.007G047600.3
Synonym Sb07g003890
Functional annotation expressed protein
UniProt H0I499 , A0A1B6PFM1 , A0A1B6PFS7 , A0A1Z5R909 , A0A1Z5R968
Pfam -
Panther DB PTHR34361 PTHR34361:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055132
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G412700 histone-arginine methyltransferase CARM1, putative, expressed K05931: CARM1, type I protein arginine methyltransferase
2 Sobic.007G145400 expressed protein -
3 Sobic.008G092800 expressed protein -
4 Sobic.004G356200 expressed protein -
5 Sobic.003G360300 exostosin family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G080500 expressed protein -
7 Sobic.006G280100 SET domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G119600 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
9 Sobic.001G467100 SURF1, putative, expressed K14998: SURF1, surfeit locus 1 family protein
10 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
11 Sobic.002G371600 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed K16572: TUBGCP5, gamma-tubulin complex component 5
12 Sobic.004G075200 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
13 Sobic.010G262100 expressed protein -
14 Sobic.003G135500 sugar transporter superfamily, putative, expressed -
15 Sobic.001G460500 T-complex protein, putative, expressed K09495: CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma
16 Sobic.006G100800 expressed protein -
17 Sobic.006G245900 FAR1 family protein, expressed -
18 Sobic.005G114500 growth regulator related protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G173400 tetratricopeptide repeat protein 5, putative, expressed -
20 Sobic.010G188000 elongation factor, putative, expressed K12852: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component


Gene co-expression network
sample Sobic007G047600 Sobic007G047600 Sobic002G412700 Sobic002G412700 Sobic007G047600--Sobic002G412700 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic007G047600--Sobic007G145400 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic007G047600--Sobic008G092800 Sobic004G356200 Sobic004G356200 Sobic007G047600--Sobic004G356200 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic007G047600--Sobic003G360300 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic007G047600--Sobic008G080500 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic007G047600--Sobic006G280100 Sobic002G119600 Sobic002G119600 Sobic007G047600--Sobic002G119600 Sobic001G467100 Sobic001G467100 Sobic007G047600--Sobic001G467100 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic002G412700--Sobic001G248100 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic002G412700--Sobic003G405500 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic002G412700--Sobic003G314700 Sobic004G034700 Sobic004G034700 Sobic002G412700--Sobic004G034700 Sobic003G209400 Sobic003G209400 Sobic002G412700--Sobic003G209400 Sobic002G412700--Sobic007G047600 Sobic010G085200 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Sobic001G467100--Sobic001G161700 Sobic001G467100--Sobic005G110499
Octagon: transcription factors


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