Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G262100.4
Synonym Sb10g029835
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YLI5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G26450 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g59400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041735 , Zm00025a018467
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G451300 NUP155, putative, expressed K14312: NUP155, NUP170, nuclear pore complex protein Nup155
2 Sobic.010G138900 cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region family protein, expressed K11991: tRNA(adenine34) deaminase
3 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
4 Sobic.008G080500 expressed protein -
5 Sobic.002G043100 histone deacetylase, putative, expressed K11407: histone deacetylase 6
6 Sobic.002G399800 PWWP domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G371600 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed K16572: TUBGCP5, gamma-tubulin complex component 5
8 Sobic.003G314700 expressed protein -
9 Sobic.008G092800 expressed protein -
10 Sobic.007G168300 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY, putative, expressed -
11 Sobic.003G123100 expressed protein K03352: anaphase-promoting complex subunit 5
12 Sobic.003G309050 - -
13 Sobic.001G453000 no apical meristem protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G051700 expressed protein -
15 Sobic.001G393900 FAD binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G142000 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G174700 expressed protein -
18 Sobic.007G145400 expressed protein -
19 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic010G262100--Sobic001G451300 Sobic010G138900 Sobic010G138900 Sobic010G262100--Sobic010G138900 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic010G262100--Sobic001G248100 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic010G262100--Sobic008G080500 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic010G262100--Sobic002G043100 Sobic002G399800 Sobic002G399800 Sobic010G262100--Sobic002G399800 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic010G262100--Sobic002G371600 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic010G262100--Sobic003G314700 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic010G262100--Sobic008G092800 Sobic001G451300--Sobic010G262100 Sobic004G034700 Sobic004G034700 Sobic001G451300--Sobic004G034700 Sobic001G451300--Sobic010G138900 Sobic001G451300--Sobic002G043100 Sobic003G309050 Sobic003G309050 Sobic001G451300--Sobic003G309050 Sobic010G174700 Sobic010G174700 Sobic001G451300--Sobic010G174700 Sobic001G451300--Sobic002G371600 Sobic009G142000 Sobic009G142000 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Sobic008G092800--Sobic006G181800 Sobic008G092800--Sobic002G371600
Octagon: transcription factors


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