Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G145400.1
Synonym Sb07g022020
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YLQ8
Pfam -
Panther DB PTHR36308 PTHR36308:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G20720 : dentin sialophosphoprotein-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34760.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005819 , Zm00025a030726
Brachypodium KQJ98505 , KQJ98506
Barley HORVU1Hr1G067240.2 , HORVU1Hr1G067240.3 , HORVU1Hr1G067240.1
Wheat TraesCS1D02G314200 , TraesCS1A02G313700 , TraesCS1A02G313700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G145400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G474400 conserved oligomeric Golgi complex component 8, putative, expressed -
2 Sobic.009G003700 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
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4 Sobic.002G119600 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
5 Sobic.006G261400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
6 Sobic.003G314700 expressed protein -
7 Sobic.001G467100 SURF1, putative, expressed K14998: SURF1, surfeit locus 1 family protein
8 Sobic.008G092800 expressed protein -
9 Sobic.006G245900 FAR1 family protein, expressed -
10 Sobic.003G296900 expressed protein -
11 Sobic.001G117800 coatomer alpha subunit, putative, expressed K05236: COPA, coatomer subunit alpha
12 Sobic.007G047600 expressed protein -
13 Sobic.008G124800 expressed protein -
14 Sobic.005G106200 expressed protein K10290: F-box protein 3
15 Sobic.010G000800 PHD-finger domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G255800 CPuORF15 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
17 Sobic.005G115500 bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase, putative, expressed K13998: dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
18 Sobic.004G053500 HEAT repeat family protein, putative, expressed K17263: CAND1, cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1
19 Sobic.005G110499 - K14006: protein transport protein SEC23
20 Sobic.005G114500 growth regulator related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic001G474400 Sobic001G474400 Sobic007G145400--Sobic001G474400 Sobic009G003700 Sobic009G003700 Sobic007G145400--Sobic009G003700 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic007G145400--Sobic001G248100 Sobic002G119600 Sobic002G119600 Sobic007G145400--Sobic002G119600 Sobic006G261400 Sobic006G261400 Sobic007G145400--Sobic006G261400 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic007G145400--Sobic003G314700 Sobic001G467100 Sobic001G467100 Sobic007G145400--Sobic001G467100 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic007G145400--Sobic008G092800 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic007G145400--Sobic006G245900 Sobic005G110499 Sobic005G110499 Sobic001G474400--Sobic005G110499 Sobic003G397900 Sobic003G397900 Sobic001G474400--Sobic003G397900 Sobic001G474400--Sobic007G145400 Sobic001G097900 Sobic001G097900 Sobic001G474400--Sobic001G097900 Sobic005G114500 Sobic005G114500 Sobic001G474400--Sobic005G114500 Sobic005G106200 Sobic005G106200 Sobic001G474400--Sobic005G106200 Sobic010G223400 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Octagon: transcription factors


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