Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G431600.1
Synonym Sb03g046337
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XIJ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04790.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G135500 sugar transporter superfamily, putative, expressed -
2 Sobic.001G203500 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.008G092800 expressed protein -
4 Sobic.006G181800 gamma-tubulin complex component 6, putative, expressed K16573: TUBGCP6, gamma-tubulin complex component 6
5 Sobic.003G250900 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G300000 - -
7 Sobic.001G541000 MYB family transcription factor, putative, expressed K11111: TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
8 Sobic.002G426100 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed -
9 Sobic.006G265600 oligosaccharyl transferase, putative, expressed K07151: dolichyl-diphosphooligosaccharide---protein glycosyltransferase
10 Sobic.003G016500 histone-lysine N-methyltransferase ATX5, putative, expressed -
11 Sobic.009G120400 methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.009G049200 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed K16571: TUBGCP4, gamma-tubulin complex component 4
13 Sobic.004G157500 RNA polymerase III RPC4 domain containing protein, expressed K03026: RPC4, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4
14 Sobic.003G299500 expressed protein -
15 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G143800 nodal modulator 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.008G080500 expressed protein -
18 Sobic.010G227000 pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.008G111600 heat shock protein, putative, expressed K09487: HSP90B, heat shock protein 90kDa beta
20 Sobic.007G184100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G431600 Sobic003G431600 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic003G431600--Sobic003G135500 Sobic001G203500 Sobic001G203500 Sobic003G431600--Sobic001G203500 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic003G431600--Sobic008G092800 Sobic006G181800 Sobic006G181800 Sobic003G431600--Sobic006G181800 Sobic003G250900 Sobic003G250900 Sobic003G431600--Sobic003G250900 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic003G431600--Sobic001G300000 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic003G431600--Sobic001G541000 Sobic002G426100 Sobic002G426100 Sobic003G431600--Sobic002G426100 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic003G431600--Sobic006G265600 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic003G135500--Sobic006G280100 Sobic003G135500--Sobic003G431600 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic003G135500--Sobic003G299500 Sobic003G135500--Sobic006G181800 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G135500--Sobic009G120400 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic003G135500--Sobic003G360300 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic003G135500--Sobic008G080500 Sobic003G135500--Sobic008G092800 Sobic002G079100 Sobic002G079100 Sobic003G135500--Sobic002G079100 Sobic001G203500--Sobic003G431600 Sobic004G157500 Sobic004G157500 Sobic001G203500--Sobic004G157500 Sobic004G064600 Sobic004G064600 Sobic001G203500--Sobic004G064600 Sobic004G354100 Sobic004G354100 Sobic001G203500--Sobic004G354100 Sobic001G203500--Sobic006G265600 Sobic001G203500--Sobic002G426100 Sobic009G260700 Sobic009G260700 Sobic001G203500--Sobic009G260700 Sobic001G191900 Sobic001G191900 Sobic001G203500--Sobic001G191900 Sobic001G203500--Sobic003G135500 Sobic003G143800 Sobic003G143800 Sobic008G092800--Sobic003G143800 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic008G092800--Sobic007G145400 Sobic003G016500 Sobic003G016500 Sobic008G092800--Sobic003G016500 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic008G092800--Sobic001G248100 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic008G092800--Sobic010G262100 Sobic001G437400 Sobic001G437400 Sobic008G092800--Sobic001G437400 Sobic007G047600 Sobic007G047600 Sobic008G092800--Sobic007G047600 Sobic008G092800--Sobic006G181800 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic008G092800--Sobic002G371600 Sobic008G111600 Sobic008G111600 Sobic006G181800--Sobic008G111600 Sobic004G038100 Sobic004G038100 Sobic006G181800--Sobic004G038100 Sobic006G181800--Sobic002G426100 Sobic006G033101 Sobic006G033101 Sobic006G181800--Sobic006G033101 Sobic006G181800--Sobic002G371600 Sobic002G043000 Sobic002G043000 Sobic006G181800--Sobic002G043000 Sobic006G181800--Sobic008G092800 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic006G181800--Sobic006G236000 Sobic010G188000 Sobic010G188000 Sobic006G181800--Sobic010G188000 Sobic003G250900--Sobic001G437400 Sobic002G150800 Sobic002G150800 Sobic003G250900--Sobic002G150800 Sobic001G143600 Sobic001G143600 Sobic003G250900--Sobic001G143600 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic003G250900--Sobic003G314700 Sobic010G138900 Sobic010G138900 Sobic003G250900--Sobic010G138900 Sobic009G049200 Sobic009G049200 Sobic003G250900--Sobic009G049200 Sobic003G250900--Sobic006G265600 Sobic002G051800 Sobic002G051800 Sobic003G250900--Sobic002G051800 Sobic003G250900--Sobic006G280100 Sobic003G177000 Sobic003G177000 Sobic001G300000--Sobic003G177000 Sobic001G300000--Sobic001G541000 Sobic007G209600 Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G209600 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic001G300000--Sobic007G159200 Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic001G300000--Sobic007G184100 Sobic001G300000--Sobic008G080500 Sobic001G300000--Sobic006G280100 Sobic001G300000--Sobic003G135500 Sobic001G211500 Sobic001G211500 Sobic001G300000--Sobic001G211500 Sobic001G036300 Sobic001G036300 Sobic001G541000--Sobic001G036300 Sobic001G541000--Sobic003G177000 Sobic001G541000--Sobic001G300000 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic001G541000--Sobic009G101000 Sobic001G541000--Sobic007G184100 Sobic001G541000--Sobic006G280100 Sobic001G541000--Sobic003G431600 Sobic001G541000--Sobic003G135500 Sobic010G153300 Sobic010G153300 Sobic001G541000--Sobic010G153300 Sobic002G426100--Sobic009G120400 Sobic002G426100--Sobic008G111600 Sobic002G426100--Sobic006G181800 Sobic002G078100 Sobic002G078100 Sobic002G426100--Sobic002G078100 Sobic002G426100--Sobic002G043000 Sobic006G017800 Sobic006G017800 Sobic002G426100--Sobic006G017800 Sobic002G066800 Sobic002G066800 Sobic002G426100--Sobic002G066800 Sobic007G186400 Sobic007G186400 Sobic002G426100--Sobic007G186400 Sobic004G129500 Sobic004G129500 Sobic002G426100--Sobic004G129500 Sobic003G397900 Sobic003G397900 Sobic006G265600--Sobic003G397900 Sobic001G474400 Sobic001G474400 Sobic006G265600--Sobic001G474400 Sobic002G399900 Sobic002G399900 Sobic006G265600--Sobic002G399900 Sobic003G005900 Sobic003G005900 Sobic006G265600--Sobic003G005900 Sobic001G151600 Sobic001G151600 Sobic006G265600--Sobic001G151600 Sobic002G075900 Sobic002G075900 Sobic006G265600--Sobic002G075900 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic006G265600--Sobic002G160700 Sobic009G120500 Sobic009G120500 Sobic006G265600--Sobic009G120500 Sobic002G364900 Sobic002G364900 Sobic006G265600--Sobic002G364900
Octagon: transcription factors


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