Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G541000.1
Synonym Sb01g050320
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt C5WMS3
Pfam PF00249
Panther DB PTHR21717
NCBI CDD -
KEGG Orthology K11111; TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G58340 : myb-like HTH transcriptional regulator family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08290.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041691 , Zm00025a015410 , Zm00025a049800
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G146500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G211500 LIG1 - Putative DNA ligase I, expressed K10747: DNA ligase 1


Gene co-expression network
sample Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic001G036300 Sobic001G036300 Sobic001G541000--Sobic001G036300 Sobic003G177000 Sobic003G177000 Sobic001G541000--Sobic003G177000 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic001G541000--Sobic001G300000 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic001G541000--Sobic009G101000 Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic001G541000--Sobic007G184100 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic001G541000--Sobic006G280100 Sobic003G431600 Sobic003G431600 Sobic001G541000--Sobic003G431600 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic001G541000--Sobic003G135500 Sobic010G153300 Sobic010G153300 Sobic001G541000--Sobic010G153300 Sobic001G036300--Sobic001G541000 Sobic009G256700 Sobic009G256700 Sobic001G036300--Sobic009G256700 Sobic001G036300--Sobic001G300000 Sobic001G036300--Sobic003G177000 Sobic001G144600 Sobic001G144600 Sobic001G036300--Sobic001G144600 Sobic002G152900 Sobic002G152900 Sobic001G036300--Sobic002G152900 Sobic002G425200 Sobic002G425200 Sobic001G036300--Sobic002G425200 Sobic003G115400 Sobic003G115400 Sobic001G036300--Sobic003G115400 Sobic010G161525 Sobic010G161525 Sobic001G036300--Sobic010G161525 Sobic003G177000--Sobic002G425200 Sobic008G038200 Sobic008G038200 Sobic003G177000--Sobic008G038200 Sobic003G177000--Sobic001G300000 Sobic003G177000--Sobic001G541000 Sobic007G161600 Sobic007G161600 Sobic003G177000--Sobic007G161600 Sobic003G177000--Sobic006G280100 Sobic001G523700 Sobic001G523700 Sobic003G177000--Sobic001G523700 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic003G177000--Sobic007G159200 Sobic008G045000 Sobic008G045000 Sobic003G177000--Sobic008G045000 Sobic001G300000--Sobic003G177000 Sobic001G300000--Sobic001G541000 Sobic007G209600 Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G159200 Sobic001G300000--Sobic007G184100 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic001G300000--Sobic008G080500 Sobic001G300000--Sobic006G280100 Sobic001G300000--Sobic003G135500 Sobic001G211500 Sobic001G211500 Sobic001G300000--Sobic001G211500 Sobic009G101000--Sobic001G541000 Sobic009G101000--Sobic006G280100 Sobic006G008300 Sobic006G008300 Sobic009G101000--Sobic006G008300 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic009G101000--Sobic001G482200 Sobic002G043000 Sobic002G043000 Sobic009G101000--Sobic002G043000 Sobic002G079100 Sobic002G079100 Sobic009G101000--Sobic002G079100 Sobic009G190200 Sobic009G190200 Sobic009G101000--Sobic009G190200 Sobic009G101000--Sobic001G300000 Sobic009G101000--Sobic003G177000 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic007G184100--Sobic001G025900 Sobic003G393100 Sobic003G393100 Sobic007G184100--Sobic003G393100 Sobic004G307900 Sobic004G307900 Sobic007G184100--Sobic004G307900 Sobic007G184100--Sobic001G300000 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G184100--Sobic001G377700 Sobic001G013400 Sobic001G013400 Sobic007G184100--Sobic001G013400 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic007G184100--Sobic005G104300 Sobic007G007800 Sobic007G007800 Sobic007G184100--Sobic007G007800 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic007G184100--Sobic002G317700 Sobic006G280100--Sobic009G190200 Sobic002G219900 Sobic002G219900 Sobic006G280100--Sobic002G219900 Sobic004G043750 Sobic004G043750 Sobic006G280100--Sobic004G043750 Sobic004G038100 Sobic004G038100 Sobic006G280100--Sobic004G038100 Sobic006G280100--Sobic007G159200 Sobic006G280100--Sobic003G135500 Sobic007G125700 Sobic007G125700 Sobic006G280100--Sobic007G125700 Sobic006G280100--Sobic002G079100 Sobic006G280100--Sobic008G080500 Sobic003G431600--Sobic003G135500 Sobic001G203500 Sobic001G203500 Sobic003G431600--Sobic001G203500 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic003G431600--Sobic008G092800 Sobic006G181800 Sobic006G181800 Sobic003G431600--Sobic006G181800 Sobic003G250900 Sobic003G250900 Sobic003G431600--Sobic003G250900 Sobic003G431600--Sobic001G300000 Sobic003G431600--Sobic001G541000 Sobic002G426100 Sobic002G426100 Sobic003G431600--Sobic002G426100 Sobic006G265600 Sobic006G265600 Sobic003G431600--Sobic006G265600 Sobic003G135500--Sobic006G280100 Sobic003G135500--Sobic003G431600 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic003G135500--Sobic003G299500 Sobic003G135500--Sobic006G181800 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G135500--Sobic009G120400 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic003G135500--Sobic003G360300 Sobic003G135500--Sobic008G080500 Sobic003G135500--Sobic008G092800 Sobic003G135500--Sobic002G079100 Sobic009G191500 Sobic009G191500 Sobic010G153300--Sobic009G191500 Sobic004G215900 Sobic004G215900 Sobic010G153300--Sobic004G215900 Sobic010G097500 Sobic010G097500 Sobic010G153300--Sobic010G097500 Sobic010G038800 Sobic010G038800 Sobic010G153300--Sobic010G038800 Sobic010G153300--Sobic002G043000 Sobic007G059700 Sobic007G059700 Sobic010G153300--Sobic007G059700 Sobic008G068100 Sobic008G068100 Sobic010G153300--Sobic008G068100 Sobic005G098000 Sobic005G098000 Sobic010G153300--Sobic005G098000 Sobic006G206200 Sobic006G206200 Sobic010G153300--Sobic006G206200
Octagon: transcription factors


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