Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G184100.3
Synonym TTN9, Sb07g025420
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RAI0
Pfam -
Panther DB PTHR35489 PTHR35489:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G20070 : titan9
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024087 , Zm00025a035240
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G025900 expressed protein -
2 Sobic.003G393100 chromosome segregation protein, putative, expressed K06674: structural maintenance of chromosome 2
3 Sobic.004G307900 expressed protein K10875: RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54 and RAD54-like protein
4 Sobic.001G300000 - -
5 Sobic.001G377700 expressed protein K10895: fanconi anemia group I protein
6 Sobic.001G013400 nuf2 family protein, expressed -
7 Sobic.005G104300 - -
8 Sobic.007G007800 DNA repair metallo-beta-lactamase, putative, expressed K15340: DCLRE1A, SNM1A, DNA cross-link repair 1A protein
9 Sobic.002G317700 BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G290000 helicase, putative, expressed K15362: BRIP1, BACH1, fanconi anemia group J protein
11 Sobic.007G076200 VERNALIZATION-INSENSITIVE, putative, expressed -
12 Sobic.004G328300 expressed protein -
13 Sobic.010G024000 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed K00615: E2.2.1.1, tktA, transketolase
14 Sobic.007G121600 - -
15 Sobic.007G121650 - -
16 Sobic.001G541000 MYB family transcription factor, putative, expressed K11111: TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
17 Sobic.009G184200 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed K06675: structural maintenance of chromosome 4
18 Sobic.006G093200 PHD finger protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G222800 expressed protein -
20 Sobic.010G092400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic007G184100--Sobic001G025900 Sobic003G393100 Sobic003G393100 Sobic007G184100--Sobic003G393100 Sobic004G307900 Sobic004G307900 Sobic007G184100--Sobic004G307900 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic007G184100--Sobic001G300000 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G184100--Sobic001G377700 Sobic001G013400 Sobic001G013400 Sobic007G184100--Sobic001G013400 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic007G184100--Sobic005G104300 Sobic007G007800 Sobic007G007800 Sobic007G184100--Sobic007G007800 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic007G184100--Sobic002G317700 Sobic001G025900--Sobic001G013400 Sobic002G113400 Sobic002G113400 Sobic001G025900--Sobic002G113400 Sobic002G290000 Sobic002G290000 Sobic001G025900--Sobic002G290000 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic001G025900--Sobic002G271400 Sobic005G110535 Sobic005G110535 Sobic001G025900--Sobic005G110535 Sobic004G321400 Sobic004G321400 Sobic001G025900--Sobic004G321400 Sobic004G053900 Sobic004G053900 Sobic001G025900--Sobic004G053900 Sobic004G328300 Sobic004G328300 Sobic001G025900--Sobic004G328300 Sobic006G236800 Sobic006G236800 Sobic001G025900--Sobic006G236800 Sobic009G184200 Sobic009G184200 Sobic003G393100--Sobic009G184200 Sobic002G204400 Sobic002G204400 Sobic003G393100--Sobic002G204400 Sobic003G369200 Sobic003G369200 Sobic003G393100--Sobic003G369200 Sobic001G398400 Sobic001G398400 Sobic003G393100--Sobic001G398400 Sobic008G148000 Sobic008G148000 Sobic003G393100--Sobic008G148000 Sobic006G281400 Sobic006G281400 Sobic003G393100--Sobic006G281400 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic003G393100--Sobic008G070700 Sobic003G393100--Sobic007G007800 Sobic003G393100--Sobic004G321400 Sobic004G307900--Sobic003G393100 Sobic004G307900--Sobic001G377700 Sobic004G307900--Sobic003G369200 Sobic004G307900--Sobic009G184200 Sobic003G423600 Sobic003G423600 Sobic004G307900--Sobic003G423600 Sobic004G307900--Sobic006G281400 Sobic004G307900--Sobic002G290000 Sobic004G156200 Sobic004G156200 Sobic004G307900--Sobic004G156200 Sobic004G307900--Sobic002G204400 Sobic003G177000 Sobic003G177000 Sobic001G300000--Sobic003G177000 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic001G300000--Sobic001G541000 Sobic007G209600 Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G209600 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic001G300000--Sobic007G159200 Sobic001G300000--Sobic007G184100 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic001G300000--Sobic008G080500 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic001G300000--Sobic006G280100 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic001G300000--Sobic003G135500 Sobic001G211500 Sobic001G211500 Sobic001G300000--Sobic001G211500 Sobic001G377700--Sobic002G290000 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic001G377700--Sobic002G021200 Sobic003G183700 Sobic003G183700 Sobic001G377700--Sobic003G183700 Sobic001G377700--Sobic005G110535 Sobic003G055600 Sobic003G055600 Sobic001G377700--Sobic003G055600 Sobic006G195500 Sobic006G195500 Sobic001G377700--Sobic006G195500 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic001G377700--Sobic007G187700 Sobic007G125300 Sobic007G125300 Sobic001G377700--Sobic007G125300 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic001G377700--Sobic005G157300 Sobic001G013400--Sobic001G025900 Sobic001G013400--Sobic007G007800 Sobic001G013400--Sobic002G290000 Sobic001G013400--Sobic002G113400 Sobic008G129200 Sobic008G129200 Sobic001G013400--Sobic008G129200 Sobic001G142000 Sobic001G142000 Sobic001G013400--Sobic001G142000 Sobic001G013400--Sobic005G110535 Sobic001G083300 Sobic001G083300 Sobic001G013400--Sobic001G083300 Sobic004G331600 Sobic004G331600 Sobic001G013400--Sobic004G331600 Sobic005G104300--Sobic001G025900 Sobic005G104300--Sobic002G317700 Sobic007G121650 Sobic007G121650 Sobic005G104300--Sobic007G121650 Sobic005G104300--Sobic007G184100 Sobic004G243900 Sobic004G243900 Sobic005G104300--Sobic004G243900 Sobic002G186966 Sobic002G186966 Sobic005G104300--Sobic002G186966 Sobic005G140100 Sobic005G140100 Sobic005G104300--Sobic005G140100 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic005G104300--Sobic004G190500 Sobic005G104300--Sobic004G321400 Sobic002G272300 Sobic002G272300 Sobic007G007800--Sobic002G272300 Sobic001G105800 Sobic001G105800 Sobic007G007800--Sobic001G105800 Sobic007G007800--Sobic009G184200 Sobic007G007800--Sobic001G013400 Sobic002G223900 Sobic002G223900 Sobic007G007800--Sobic002G223900 Sobic007G007800--Sobic004G331600 Sobic005G020100 Sobic005G020100 Sobic007G007800--Sobic005G020100 Sobic010G092400 Sobic010G092400 Sobic007G007800--Sobic010G092400 Sobic007G007800--Sobic001G083300 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic002G317700--Sobic002G112000 Sobic002G317700--Sobic010G092400 Sobic002G317700--Sobic008G070700 Sobic004G267600 Sobic004G267600 Sobic002G317700--Sobic004G267600 Sobic006G274200 Sobic006G274200 Sobic002G317700--Sobic006G274200 Sobic009G202801 Sobic009G202801 Sobic002G317700--Sobic009G202801 Sobic006G211900 Sobic006G211900 Sobic002G317700--Sobic006G211900 Sobic004G234500 Sobic004G234500 Sobic002G317700--Sobic004G234500 Sobic007G188001 Sobic007G188001 Sobic002G317700--Sobic007G188001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.