Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G104300.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHR8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.005G104300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G025900 expressed protein -
2 Sobic.002G317700 BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G121650 - -
4 Sobic.007G184100 expressed protein -
5 Sobic.004G243900 E2F family transcription factor protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G186966 - -
7 Sobic.005G140100 - -
8 Sobic.004G190500 sucrose transporters("PubMedID : 27986867,PubMedID : 23805151")@Sucrose transporter genes(PubMedID : 24456189)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@sucrose transporter BoSUT1, putative, expressed K15378: solute carrier family 45, member 1/2/4
9 Sobic.004G321400 BRUSHY 1, putative, expressed -
10 Sobic.001G013400 nuf2 family protein, expressed -
11 Sobic.004G328300 expressed protein -
12 Sobic.007G007800 DNA repair metallo-beta-lactamase, putative, expressed K15340: DCLRE1A, SNM1A, DNA cross-link repair 1A protein
13 Sobic.001G377700 expressed protein K10895: fanconi anemia group I protein
14 Sobic.004G238801 - -
15 Sobic.004G307900 expressed protein K10875: RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54 and RAD54-like protein
16 Sobic.010G092400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G290000 helicase, putative, expressed K15362: BRIP1, BACH1, fanconi anemia group J protein
18 Sobic.003G188600 expressed protein -
19 Sobic.009G099150 - -
20 Sobic.005G110535 - K02540: DNA replication licensing factor MCM2


Gene co-expression network
sample Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic005G104300--Sobic001G025900 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic005G104300--Sobic002G317700 Sobic007G121650 Sobic007G121650 Sobic005G104300--Sobic007G121650 Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic005G104300--Sobic007G184100 Sobic004G243900 Sobic004G243900 Sobic005G104300--Sobic004G243900 Sobic002G186966 Sobic002G186966 Sobic005G104300--Sobic002G186966 Sobic005G140100 Sobic005G140100 Sobic005G104300--Sobic005G140100 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic005G104300--Sobic004G190500 Sobic004G321400 Sobic004G321400 Sobic005G104300--Sobic004G321400 Sobic001G013400 Sobic001G013400 Sobic001G025900--Sobic001G013400 Sobic002G113400 Sobic002G113400 Sobic001G025900--Sobic002G113400 Sobic002G290000 Sobic002G290000 Sobic001G025900--Sobic002G290000 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic001G025900--Sobic002G271400 Sobic005G110535 Sobic005G110535 Sobic001G025900--Sobic005G110535 Sobic001G025900--Sobic004G321400 Sobic004G053900 Sobic004G053900 Sobic001G025900--Sobic004G053900 Sobic004G328300 Sobic004G328300 Sobic001G025900--Sobic004G328300 Sobic006G236800 Sobic006G236800 Sobic001G025900--Sobic006G236800 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic002G317700--Sobic002G112000 Sobic010G092400 Sobic010G092400 Sobic002G317700--Sobic010G092400 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic002G317700--Sobic008G070700 Sobic004G267600 Sobic004G267600 Sobic002G317700--Sobic004G267600 Sobic006G274200 Sobic006G274200 Sobic002G317700--Sobic006G274200 Sobic009G202801 Sobic009G202801 Sobic002G317700--Sobic009G202801 Sobic006G211900 Sobic006G211900 Sobic002G317700--Sobic006G211900 Sobic004G234500 Sobic004G234500 Sobic002G317700--Sobic004G234500 Sobic007G188001 Sobic007G188001 Sobic002G317700--Sobic007G188001 Sobic007G121600 Sobic007G121600 Sobic007G121650--Sobic007G121600 Sobic004G238801 Sobic004G238801 Sobic007G121650--Sobic004G238801 Sobic007G007800 Sobic007G007800 Sobic007G121650--Sobic007G007800 Sobic003G129200 Sobic003G129200 Sobic007G121650--Sobic003G129200 Sobic003G374100 Sobic003G374100 Sobic007G121650--Sobic003G374100 Sobic001G118800 Sobic001G118800 Sobic007G121650--Sobic001G118800 Sobic010G204700 Sobic010G204700 Sobic007G121650--Sobic010G204700 Sobic005G020100 Sobic005G020100 Sobic007G121650--Sobic005G020100 Sobic007G121650--Sobic010G092400 Sobic007G184100--Sobic001G025900 Sobic003G393100 Sobic003G393100 Sobic007G184100--Sobic003G393100 Sobic004G307900 Sobic004G307900 Sobic007G184100--Sobic004G307900 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic007G184100--Sobic001G300000 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G184100--Sobic001G377700 Sobic007G184100--Sobic001G013400 Sobic007G184100--Sobic005G104300 Sobic007G184100--Sobic007G007800 Sobic007G184100--Sobic002G317700 Sobic009G087000 Sobic009G087000 Sobic004G243900--Sobic009G087000 Sobic003G183700 Sobic003G183700 Sobic004G243900--Sobic003G183700 Sobic003G179500 Sobic003G179500 Sobic004G243900--Sobic003G179500 Sobic006G051000 Sobic006G051000 Sobic004G243900--Sobic006G051000 Sobic004G243900--Sobic005G110535 Sobic003G292700 Sobic003G292700 Sobic004G243900--Sobic003G292700 Sobic010G147700 Sobic010G147700 Sobic004G243900--Sobic010G147700 Sobic003G289800 Sobic003G289800 Sobic004G243900--Sobic003G289800 Sobic008G129200 Sobic008G129200 Sobic004G243900--Sobic008G129200 Sobic002G186966--Sobic005G104300 Sobic002G186966--Sobic001G025900 Sobic001G288000 Sobic001G288000 Sobic002G186966--Sobic001G288000 Sobic002G186966--Sobic007G184100 Sobic003G088600 Sobic003G088600 Sobic002G186966--Sobic003G088600 Sobic010G243100 Sobic010G243100 Sobic002G186966--Sobic010G243100 Sobic010G024000 Sobic010G024000 Sobic002G186966--Sobic010G024000 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic002G186966--Sobic010G030000 Sobic002G259301 Sobic002G259301 Sobic002G186966--Sobic002G259301 Sobic005G140100--Sobic005G104300 Sobic005G140100--Sobic004G243900 Sobic005G140100--Sobic003G179500 Sobic006G116500 Sobic006G116500 Sobic005G140100--Sobic006G116500 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic005G140100--Sobic010G165900 Sobic005G140100--Sobic003G183700 Sobic005G140100--Sobic008G129200 Sobic004G331600 Sobic004G331600 Sobic005G140100--Sobic004G331600 Sobic005G140100--Sobic006G051000 Sobic004G190500--Sobic002G112000 Sobic002G190000 Sobic002G190000 Sobic004G190500--Sobic002G190000 Sobic004G190500--Sobic004G321400 Sobic004G190500--Sobic002G317700 Sobic003G204200 Sobic003G204200 Sobic004G190500--Sobic003G204200 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic004G190500--Sobic004G317000 Sobic004G190500--Sobic001G118800 Sobic004G190500--Sobic007G121650 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic004G190500--Sobic009G143200 Sobic004G321400--Sobic003G183700 Sobic004G321400--Sobic009G087000 Sobic004G321400--Sobic005G110535 Sobic004G321400--Sobic002G290000 Sobic003G369200 Sobic003G369200 Sobic004G321400--Sobic003G369200 Sobic004G321400--Sobic008G129200 Sobic004G095200 Sobic004G095200 Sobic004G321400--Sobic004G095200 Sobic009G172950 Sobic009G172950 Sobic004G321400--Sobic009G172950 Sobic004G321400--Sobic004G331600
Octagon: transcription factors


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