Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G045000.1
Synonym Sb08g003860
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YS85
Pfam -
Panther DB PTHR33304 PTHR33304:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G43770 : RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053964 , Zm00025a053962
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G161600 SET domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G216500 expressed protein -
3 Sobic.009G259900 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
4 Sobic.006G179300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G177000 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
6 Sobic.009G177200 glycosyl transferase, family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
7 Sobic.003G072500 transcription factor X1, putative, expressed -
8 Sobic.001G300000 - -
9 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -
10 Sobic.002G317700 BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G063600 glycosyl hydrolase family protein 27, putative, expressed -
12 Sobic.003G104100 expressed protein -
13 Sobic.010G227000 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G163400 dnaJ domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G219900 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed K16570: TUBGCP3, gamma-tubulin complex component 3
17 Sobic.005G062600 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
18 Sobic.004G149400 ankyrin, putative, expressed -
19 Sobic.008G151600 PMR5, putative, expressed -
20 Sobic.003G129500 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C


Gene co-expression network
sample Sobic008G045000 Sobic008G045000 Sobic007G161600 Sobic007G161600 Sobic008G045000--Sobic007G161600 Sobic009G216500 Sobic009G216500 Sobic008G045000--Sobic009G216500 Sobic009G259900 Sobic009G259900 Sobic008G045000--Sobic009G259900 Sobic006G179300 Sobic006G179300 Sobic008G045000--Sobic006G179300 Sobic003G177000 Sobic003G177000 Sobic008G045000--Sobic003G177000 Sobic009G177200 Sobic009G177200 Sobic008G045000--Sobic009G177200 Sobic003G072500 Sobic003G072500 Sobic008G045000--Sobic003G072500 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic008G045000--Sobic001G300000 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic008G045000--Sobic006G112700 Sobic008G151600 Sobic008G151600 Sobic007G161600--Sobic008G151600 Sobic005G062600 Sobic005G062600 Sobic007G161600--Sobic005G062600 Sobic007G147200 Sobic007G147200 Sobic007G161600--Sobic007G147200 Sobic001G043500 Sobic001G043500 Sobic007G161600--Sobic001G043500 Sobic003G019900 Sobic003G019900 Sobic007G161600--Sobic003G019900 Sobic010G092400 Sobic010G092400 Sobic007G161600--Sobic010G092400 Sobic006G163300 Sobic006G163300 Sobic007G161600--Sobic006G163300 Sobic003G008800 Sobic003G008800 Sobic007G161600--Sobic003G008800 Sobic003G046400 Sobic003G046400 Sobic007G161600--Sobic003G046400 Sobic006G022400 Sobic006G022400 Sobic009G216500--Sobic006G022400 Sobic004G199200 Sobic004G199200 Sobic009G216500--Sobic004G199200 Sobic004G149400 Sobic004G149400 Sobic009G216500--Sobic004G149400 Sobic006G008300 Sobic006G008300 Sobic009G216500--Sobic006G008300 Sobic009G216500--Sobic008G045000 Sobic006G106200 Sobic006G106200 Sobic009G216500--Sobic006G106200 Sobic004G207000 Sobic004G207000 Sobic009G216500--Sobic004G207000 Sobic004G313500 Sobic004G313500 Sobic009G216500--Sobic004G313500 Sobic009G216500--Sobic005G062600 Sobic001G395200 Sobic001G395200 Sobic009G259900--Sobic001G395200 Sobic004G043750 Sobic004G043750 Sobic009G259900--Sobic004G043750 Sobic003G104100 Sobic003G104100 Sobic009G259900--Sobic003G104100 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic009G259900--Sobic003G129500 Sobic009G259900--Sobic008G045000 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic009G259900--Sobic005G153000 Sobic009G259900--Sobic006G008300 Sobic010G149600 Sobic010G149600 Sobic009G259900--Sobic010G149600 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic009G259900--Sobic005G163400 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic006G179300--Sobic003G360300 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic006G179300--Sobic008G080500 Sobic008G015200 Sobic008G015200 Sobic006G179300--Sobic008G015200 Sobic003G027800 Sobic003G027800 Sobic006G179300--Sobic003G027800 Sobic007G125700 Sobic007G125700 Sobic006G179300--Sobic007G125700 Sobic006G179300--Sobic008G045000 Sobic004G342300 Sobic004G342300 Sobic006G179300--Sobic004G342300 Sobic001G385400 Sobic001G385400 Sobic006G179300--Sobic001G385400 Sobic002G219900 Sobic002G219900 Sobic006G179300--Sobic002G219900 Sobic002G425200 Sobic002G425200 Sobic003G177000--Sobic002G425200 Sobic008G038200 Sobic008G038200 Sobic003G177000--Sobic008G038200 Sobic003G177000--Sobic001G300000 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic003G177000--Sobic001G541000 Sobic003G177000--Sobic007G161600 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic003G177000--Sobic006G280100 Sobic001G523700 Sobic001G523700 Sobic003G177000--Sobic001G523700 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic003G177000--Sobic007G159200 Sobic003G177000--Sobic008G045000 Sobic001G537400 Sobic001G537400 Sobic009G177200--Sobic001G537400 Sobic009G002900 Sobic009G002900 Sobic009G177200--Sobic009G002900 Sobic001G199500 Sobic001G199500 Sobic009G177200--Sobic001G199500 Sobic009G177200--Sobic001G395200 Sobic008G113300 Sobic008G113300 Sobic009G177200--Sobic008G113300 Sobic009G177200--Sobic008G045000 Sobic003G223000 Sobic003G223000 Sobic009G177200--Sobic003G223000 Sobic006G140400 Sobic006G140400 Sobic009G177200--Sobic006G140400 Sobic001G425700 Sobic001G425700 Sobic009G177200--Sobic001G425700 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic003G072500--Sobic008G070700 Sobic003G393100 Sobic003G393100 Sobic003G072500--Sobic003G393100 Sobic009G057800 Sobic009G057800 Sobic003G072500--Sobic009G057800 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic003G072500--Sobic002G112000 Sobic001G175100 Sobic001G175100 Sobic003G072500--Sobic001G175100 Sobic003G072500--Sobic006G106200 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic003G072500--Sobic002G317700 Sobic003G072500--Sobic007G161600 Sobic003G072500--Sobic003G129500 Sobic001G300000--Sobic003G177000 Sobic001G300000--Sobic001G541000 Sobic007G209600 Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G209600 Sobic001G300000--Sobic007G159200 Sobic007G184100 Sobic007G184100 Sobic001G300000--Sobic007G184100 Sobic001G300000--Sobic008G080500 Sobic001G300000--Sobic006G280100 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic001G300000--Sobic003G135500 Sobic001G211500 Sobic001G211500 Sobic001G300000--Sobic001G211500 Sobic006G112700--Sobic008G080500 Sobic003G209400 Sobic003G209400 Sobic006G112700--Sobic003G209400 Sobic001G239800 Sobic001G239800 Sobic006G112700--Sobic001G239800 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic006G112700--Sobic006G236000 Sobic009G142000 Sobic009G142000 Sobic006G112700--Sobic009G142000 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic006G112700--Sobic010G262100 Sobic003G123100 Sobic003G123100 Sobic006G112700--Sobic003G123100 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic006G112700--Sobic008G092800 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic006G112700--Sobic001G451300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.