Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G162500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBP7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G258900 - -
2 Sobic.001G300900 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G341700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G088842 - -
5 Sobic.002G340200 expressed protein -
6 Sobic.004G135900 - -
7 Sobic.010G172000 - -
8 Sobic.009G107080 - -
9 Sobic.006G063001 - -
10 Sobic.003G311600 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
11 Sobic.001G482200 FAR1 family protein, expressed K17604: zinc finger SWIM domain-containing protein 3
12 Sobic.006G269800 TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit, putative, expressed K03144: TFIIH4, GTF2H4, transcription initiation factor TFIIH subunit 4
13 Sobic.007G070000 polyprenyl synthetase, putative, expressed K14066: geranyl diphosphate synthase
14 Sobic.002G431400 - -
15 Sobic.006G169500 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K01444: AGA, N4-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase
16 Sobic.002G031500 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G356200 expressed protein -
19 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G167800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic001G258900--Sobic002G162500 Sobic001G258900--Sobic010G172000 Sobic001G258900--Sobic003G341700 Sobic001G258900--Sobic009G107080 Sobic001G258900--Sobic006G063001 Sobic008G097600 Sobic008G097600 Sobic001G258900--Sobic008G097600 Sobic001G258900--Sobic001G300900 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic001G258900--Sobic008G092532 Sobic003G311600 Sobic003G311600 Sobic001G258900--Sobic003G311600 Sobic001G300900--Sobic002G162500 Sobic006G208400 Sobic006G208400 Sobic001G300900--Sobic006G208400 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic001G300900--Sobic006G269800 Sobic003G361400 Sobic003G361400 Sobic001G300900--Sobic003G361400 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic001G300900--Sobic004G119400 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic008G088842 Sobic001G300900--Sobic003G341700 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic001G300900--Sobic008G017100 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic003G341700--Sobic006G112700 Sobic006G067700 Sobic006G067700 Sobic003G341700--Sobic006G067700 Sobic003G341700--Sobic002G162500 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic003G341700--Sobic008G080500 Sobic003G341700--Sobic001G258900 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic003G341700--Sobic005G200900 Sobic010G038100 Sobic010G038100 Sobic003G341700--Sobic010G038100 Sobic003G127500 Sobic003G127500 Sobic003G341700--Sobic003G127500 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic003G341700--Sobic004G355800 Sobic010G138900 Sobic010G138900 Sobic008G088842--Sobic010G138900 Sobic006G140600 Sobic006G140600 Sobic008G088842--Sobic006G140600 Sobic002G143200 Sobic002G143200 Sobic008G088842--Sobic002G143200 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic008G088842--Sobic010G262100 Sobic008G088842--Sobic003G311600 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic008G088842--Sobic001G451300 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic008G088842--Sobic006G280100 Sobic008G088842--Sobic006G208400 Sobic008G088842--Sobic002G340200 Sobic007G070000 Sobic007G070000 Sobic002G340200--Sobic007G070000 Sobic002G340200--Sobic008G088842 Sobic002G340200--Sobic002G162500 Sobic002G340200--Sobic003G311600 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic002G340200--Sobic010G089800 Sobic002G051800 Sobic002G051800 Sobic002G340200--Sobic002G051800 Sobic002G340200--Sobic001G300900 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic002G340200--Sobic007G159200 Sobic002G340200--Sobic010G138900 Sobic004G135900--Sobic006G063001 Sobic003G256600 Sobic003G256600 Sobic004G135900--Sobic003G256600 Sobic004G135900--Sobic002G162500 Sobic003G142000 Sobic003G142000 Sobic004G135900--Sobic003G142000 Sobic009G239301 Sobic009G239301 Sobic004G135900--Sobic009G239301 Sobic004G135900--Sobic010G172000 Sobic006G274100 Sobic006G274100 Sobic004G135900--Sobic006G274100 Sobic004G135900--Sobic009G107080 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic004G135900--Sobic001G346900 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic010G172000--Sobic007G054400 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G172000--Sobic004G258700 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic001G253200 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic010G172000--Sobic003G101500 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G258900 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G162500 Sobic009G107080--Sobic004G135900 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic006G063001 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic002G340200 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic006G063001--Sobic007G225800 Sobic006G063001--Sobic008G092532 Sobic006G063001--Sobic004G135900 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic010G172000 Sobic006G063001--Sobic003G142000 Sobic002G424900 Sobic002G424900 Sobic006G063001--Sobic002G424900 Sobic006G063001--Sobic001G258900 Sobic006G063001--Sobic002G162500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.