Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G172000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YKU8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g19990.2 : reticulon domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G092532 - -
2 Sobic.002G431400 - -
3 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
4 Sobic.008G047700 serine esterase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G210000 ribosomal L18p/L5e family protein, expressed -
6 Sobic.007G054400 FAR1 family protein, expressed -
7 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
8 Sobic.001G253200 mandelonitrile lyase, putative, expressed -
9 Sobic.003G101500 dnaJ domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G258900 - -
11 Sobic.007G225800 NOL1/NOP2/sun family protein, putative, expressed K15335: NSUN2, tRNA (cytosine34-C5)-methyltransferase
12 Sobic.006G059200 expressed protein K18464: RTSC, WASH complex subunit strumpellin
13 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
14 Sobic.002G228700 patatin, putative, expressed -
15 Sobic.006G063001 - -
16 Sobic.001G146600 - -
17 Sobic.002G162500 - -
18 Sobic.003G341700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G303675 - -
20 Sobic.001G227200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K00861: RFK, riboflavin kinase


Gene co-expression network
sample Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic010G172000--Sobic007G054400 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G172000--Sobic004G258700 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic001G253200 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic010G172000--Sobic003G101500 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic004G258700 Sobic008G092532--Sobic007G054400 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic008G092532--Sobic010G277500 Sobic008G092532--Sobic003G101500 Sobic008G092532--Sobic010G172000 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic008G092532--Sobic007G225800 Sobic008G092532--Sobic007G210000 Sobic008G092532--Sobic004G107200 Sobic002G431400--Sobic004G107200 Sobic002G431400--Sobic007G210000 Sobic002G431400--Sobic008G092532 Sobic002G431400--Sobic010G172000 Sobic001G540800 Sobic001G540800 Sobic002G431400--Sobic001G540800 Sobic002G309200 Sobic002G309200 Sobic002G431400--Sobic002G309200 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic002G431400--Sobic002G425500 Sobic002G197300 Sobic002G197300 Sobic002G431400--Sobic002G197300 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic002G431400--Sobic006G269800 Sobic004G107200--Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G425500 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic004G107200--Sobic006G119400 Sobic004G107200--Sobic003G101500 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic004G107200--Sobic002G043100 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic004G107200--Sobic001G501800 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G107200--Sobic001G456900 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic006G269800 Sobic008G047700--Sobic007G054400 Sobic008G047700--Sobic004G258700 Sobic008G047700--Sobic007G210000 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic008G047700--Sobic005G191900 Sobic002G233900 Sobic002G233900 Sobic008G047700--Sobic002G233900 Sobic008G047700--Sobic004G107200 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic008G047700--Sobic009G100050 Sobic006G059200 Sobic006G059200 Sobic008G047700--Sobic006G059200 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic008G047700--Sobic008G011100 Sobic007G210000--Sobic008G092532 Sobic007G210000--Sobic002G431400 Sobic007G210000--Sobic004G107200 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic007G210000--Sobic004G019500 Sobic007G210000--Sobic008G047700 Sobic007G210000--Sobic001G253200 Sobic007G210000--Sobic007G054400 Sobic010G140400 Sobic010G140400 Sobic007G210000--Sobic010G140400 Sobic007G210000--Sobic001G261900 Sobic007G054400--Sobic001G253200 Sobic004G039200 Sobic004G039200 Sobic007G054400--Sobic004G039200 Sobic007G054400--Sobic003G101500 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic007G054400--Sobic004G145500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic007G054400--Sobic003G197800 Sobic007G054400--Sobic004G258700 Sobic001G433300 Sobic001G433300 Sobic007G054400--Sobic001G433300 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic007G054400--Sobic009G065100 Sobic006G052300 Sobic006G052300 Sobic007G054400--Sobic006G052300 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G113100 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic004G258700--Sobic008G028700 Sobic004G258700--Sobic001G456900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic004G258700--Sobic003G148000 Sobic004G258700--Sobic003G101500 Sobic004G258700--Sobic010G277500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic004G258700--Sobic007G065400 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic004G258700--Sobic007G161000 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G258700--Sobic009G040600 Sobic001G253200--Sobic007G054400 Sobic005G079800 Sobic005G079800 Sobic001G253200--Sobic005G079800 Sobic001G253200--Sobic004G039200 Sobic001G253200--Sobic001G433300 Sobic001G253200--Sobic003G101500 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic001G253200--Sobic002G151600 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic001G253200--Sobic002G309800 Sobic001G253200--Sobic003G197800 Sobic008G100100 Sobic008G100100 Sobic001G253200--Sobic008G100100 Sobic003G101500--Sobic004G039200 Sobic003G101500--Sobic004G258700 Sobic003G101500--Sobic007G161000 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic003G101500--Sobic009G260500 Sobic003G101500--Sobic007G054400 Sobic003G101500--Sobic001G456900 Sobic003G101500--Sobic008G113100 Sobic003G101500--Sobic008G028700 Sobic009G024000 Sobic009G024000 Sobic003G101500--Sobic009G024000
Octagon: transcription factors


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