Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G059200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PKH3
Pfam PF10266
Panther DB PTHR15691 PTHR15691:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology K18464; RTSC, WASH complex subunit strumpellin
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G050900 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, putative, expressed K10532: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase
2 Sobic.008G047700 serine esterase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G100050 - -
4 Sobic.008G092532 - -
5 Sobic.003G070100 expressed protein -
6 Sobic.008G083000 ZOS12-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.005G191900 transporter family protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G260500 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed K14408: CSTF3, cleavage stimulation factor subunit 3
9 Sobic.001G407200 SacI homology domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G194400 cyclin-T1-4, putative, expressed K15188: cyclin T
11 Sobic.007G203200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13201: TIA1, nucleolysin TIA-1/TIAR
12 Sobic.001G532700 WD repeat-containing protein 44, putative, expressed -
13 Sobic.001G227200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K00861: RFK, riboflavin kinase
14 Sobic.010G277500 expressed protein -
15 Sobic.005G106500 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family, putative, expressed K11165: dehydrogenase/reductase SDR family member 7
16 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
17 Sobic.008G131000 domain of unknown function family protein, expressed -
18 Sobic.008G150700 protein kinase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G402600 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G018300 expressed protein K06970: 23S rRNA (adenine1618-N6)-methyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic006G059200 Sobic006G059200 Sobic009G050900 Sobic009G050900 Sobic006G059200--Sobic009G050900 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic006G059200--Sobic008G047700 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic006G059200--Sobic009G100050 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic006G059200--Sobic008G092532 Sobic003G070100 Sobic003G070100 Sobic006G059200--Sobic003G070100 Sobic008G083000 Sobic008G083000 Sobic006G059200--Sobic008G083000 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic006G059200--Sobic005G191900 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic006G059200--Sobic009G260500 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic006G059200--Sobic001G407200 Sobic003G141500 Sobic003G141500 Sobic009G050900--Sobic003G141500 Sobic007G203200 Sobic007G203200 Sobic009G050900--Sobic007G203200 Sobic001G281600 Sobic001G281600 Sobic009G050900--Sobic001G281600 Sobic009G050900--Sobic008G083000 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic009G050900--Sobic001G219600 Sobic007G071200 Sobic007G071200 Sobic009G050900--Sobic007G071200 Sobic008G011100 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Octagon: transcription factors


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