Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G070100.1
Synonym Sb03g005935
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q1R9
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45540 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g21940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055517 , Zm00025a012182
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G491600 , TraesCS2D02G039000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191900 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G100050 - -
3 Sobic.010G152850 - -
4 Sobic.009G005100 - -
5 Sobic.010G166000 ESP1, putative, expressed -
6 Sobic.009G247400 PX domain containing protein, putative, expressed K17925: sorting nexin-13
7 Sobic.002G076000 transporter-related, putative, expressed -
8 Sobic.008G149800 histone acetyltransferase HAC5, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
9 Sobic.006G059200 expressed protein K18464: RTSC, WASH complex subunit strumpellin
10 Sobic.001G303675 - -
11 Sobic.006G210000 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
12 Sobic.001G311500 N-acetylglucosaminyl transferase component, putative, expressed K03860: PIGQ, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit Q
13 Sobic.006G215050 - -
14 Sobic.006G185200 RNA polymerase IV subunit, putative, expressed K16250: DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
15 Sobic.004G119400 ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G380100 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.004G246100 nicalin, putative, expressed K06171: nicastrin
18 Sobic.004G219100 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, putative, expressed K03859: PIGC, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
19 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
20 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6


Gene co-expression network
sample Sobic003G070100 Sobic003G070100 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic003G070100--Sobic005G191900 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic003G070100--Sobic009G100050 Sobic010G152850 Sobic010G152850 Sobic003G070100--Sobic010G152850 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic003G070100--Sobic009G005100 Sobic010G166000 Sobic010G166000 Sobic003G070100--Sobic010G166000 Sobic009G247400 Sobic009G247400 Sobic003G070100--Sobic009G247400 Sobic002G076000 Sobic002G076000 Sobic003G070100--Sobic002G076000 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic003G070100--Sobic008G149800 Sobic006G059200 Sobic006G059200 Sobic003G070100--Sobic006G059200 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic005G191900--Sobic001G311500 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic005G191900--Sobic001G363500 Sobic010G094700 Sobic010G094700 Sobic005G191900--Sobic010G094700 Sobic005G191900--Sobic009G247400 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic005G191900--Sobic010G112100 Sobic007G157000 Sobic007G157000 Sobic005G191900--Sobic007G157000 Sobic006G118700 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Octagon: transcription factors


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