Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G107200.1,Sobic.004G107200.2
Synonym UBP15, Sb04g008750
Functional annotation ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed
UniProt C5XZ01
Pfam PF01753 PF13423
Panther DB PTHR24006 PTHR24006:SF503
NCBI CDD KOG1865; Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
KEGG Orthology K11855; ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G17110 : ubiquitin-specific protease 15
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g14730.1 : ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019987 , Zm00025a034472
Brachypodium PNT66262 , PNT66263 , KQJ94212 , KQJ94213 , KQJ94210 , KQJ94211
Barley -
Wheat TraesCS6D02G179700 , TraesCS6D02G179700 , TraesCS6D02G179700 , TraesCS6A02G192600 , TraesCS6A02G192600 , TraesCS6A02G192600 , TraesCS6B02G231700 , TraesCS6B02G231700 , TraesCS6B02G231700 , TraesCS6B02G231700
Populus PNT36917 , PNT36916 , PNT48968


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cDNA sequences
Sobic.004G107200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431400 - -
2 Sobic.002G425500 ATPOT1, putative, expressed -
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19 Sobic.008G132900 expressed protein -
20 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G431400 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic004G107200--Sobic002G425500 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic004G107200--Sobic006G119400 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic004G107200--Sobic003G101500 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic004G107200--Sobic002G043100 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic004G107200--Sobic001G501800 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G107200--Sobic001G456900 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic001G261900 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic004G107200--Sobic006G269800 Sobic002G431400--Sobic004G107200 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic002G431400--Sobic007G210000 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic002G431400--Sobic008G092532 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G431400--Sobic010G172000 Sobic001G540800 Sobic001G540800 Sobic002G431400--Sobic001G540800 Sobic002G309200 Sobic002G309200 Sobic002G431400--Sobic002G309200 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Octagon: transcription factors


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