Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G501800.1
Synonym Sb01g046870, REF6
Functional annotation ZOS1-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A1B6QQG3
Pfam PF02375 PF02373
Panther DB PTHR10694 PTHR10694:SF45
NCBI CDD KOG3576; Ovo and related transcription factors
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48430 : relative of early flowering 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g67970.1 : ZOS1-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053426
Brachypodium KQK23622 , KQK23623 , PNT78184
Barley -
Wheat TraesCS4A02G416800 , TraesCS4D02G314000 , TraesCS4B02G317400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G043100 histone deacetylase, putative, expressed K11407: histone deacetylase 6
2 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
3 Sobic.005G200800 homeobox domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G425500 ATPOT1, putative, expressed -
5 Sobic.003G409200 protein of unknown function, DUF618 domain containing protein, expressed K15559: regulator of Ty1 transposition protein 103
6 Sobic.001G063700 expressed protein -
7 Sobic.003G101500 dnaJ domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G360400 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08596: sentrin-specific protease 7
9 Sobic.001G346900 RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed K14292: trimethylguanosine synthase
10 Sobic.006G269800 TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit, putative, expressed K03144: TFIIH4, GTF2H4, transcription initiation factor TFIIH subunit 4
11 Sobic.002G145800 flowering time control protein FCA, putative, expressed -
12 Sobic.001G540800 DNA binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G256300 DNA binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G235300 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
15 Sobic.002G154000 EDM2, putative, expressed -
16 Sobic.005G167700 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
17 Sobic.007G159900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
18 Sobic.010G174700 expressed protein -
19 Sobic.004G155600 dnaJ domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G398800 FHA domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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