Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G258900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QL21
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G258900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G162500 - -
2 Sobic.010G172000 - -
3 Sobic.003G341700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G107080 - -
5 Sobic.006G063001 - -
6 Sobic.008G097600 cyclin-T1-4, putative, expressed K15188: cyclin T
7 Sobic.001G300900 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.008G092532 - -
9 Sobic.003G311600 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
10 Sobic.001G482200 FAR1 family protein, expressed K17604: zinc finger SWIM domain-containing protein 3
11 Sobic.002G340200 expressed protein -
12 Sobic.002G431400 - -
13 Sobic.007G070000 polyprenyl synthetase, putative, expressed K14066: geranyl diphosphate synthase
14 Sobic.007G102500 - -
15 Sobic.008G088842 - -
16 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -
17 Sobic.004G135900 - -
18 Sobic.007G210000 ribosomal L18p/L5e family protein, expressed -
19 Sobic.009G101000 - -
20 Sobic.006G039800 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic001G258900--Sobic002G162500 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic001G258900--Sobic010G172000 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic001G258900--Sobic003G341700 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic001G258900--Sobic009G107080 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic001G258900--Sobic006G063001 Sobic008G097600 Sobic008G097600 Sobic001G258900--Sobic008G097600 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic001G258900--Sobic001G300900 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic001G258900--Sobic008G092532 Sobic003G311600 Sobic003G311600 Sobic001G258900--Sobic003G311600 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic010G172000--Sobic007G054400 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G172000--Sobic004G258700 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic001G253200 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic010G172000--Sobic003G101500 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic003G341700--Sobic006G112700 Sobic006G067700 Sobic006G067700 Sobic003G341700--Sobic006G067700 Sobic003G341700--Sobic002G162500 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic003G341700--Sobic008G080500 Sobic003G341700--Sobic001G258900 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic003G341700--Sobic005G200900 Sobic010G038100 Sobic010G038100 Sobic003G341700--Sobic010G038100 Sobic003G127500 Sobic003G127500 Sobic003G341700--Sobic003G127500 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic003G341700--Sobic004G355800 Sobic001G482200 Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G482200 Sobic009G107080--Sobic001G258900 Sobic002G148400 Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G148400 Sobic009G107080--Sobic002G162500 Sobic009G107080--Sobic004G135900 Sobic009G101000 Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic009G101000 Sobic009G107080--Sobic006G063001 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic003G312700 Sobic009G107080--Sobic002G340200 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic006G063001--Sobic007G225800 Sobic006G063001--Sobic008G092532 Sobic006G063001--Sobic004G135900 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic001G172200 Sobic006G063001--Sobic010G172000 Sobic003G142000 Sobic003G142000 Sobic006G063001--Sobic003G142000 Sobic002G424900 Sobic002G424900 Sobic006G063001--Sobic002G424900 Sobic006G063001--Sobic001G258900 Sobic006G063001--Sobic002G162500 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic008G097600--Sobic002G292800 Sobic010G155600 Sobic010G155600 Sobic008G097600--Sobic010G155600 Sobic003G413100 Sobic003G413100 Sobic008G097600--Sobic003G413100 Sobic001G032200 Sobic001G032200 Sobic008G097600--Sobic001G032200 Sobic009G020100 Sobic009G020100 Sobic008G097600--Sobic009G020100 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic008G097600--Sobic006G245900 Sobic007G211800 Sobic007G211800 Sobic008G097600--Sobic007G211800 Sobic008G097600--Sobic001G258900 Sobic009G107300 Sobic009G107300 Sobic008G097600--Sobic009G107300 Sobic001G300900--Sobic002G162500 Sobic006G208400 Sobic006G208400 Sobic001G300900--Sobic006G208400 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic001G300900--Sobic006G269800 Sobic003G361400 Sobic003G361400 Sobic001G300900--Sobic003G361400 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic001G300900--Sobic004G119400 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic008G088842 Sobic001G300900--Sobic003G341700 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic001G300900--Sobic008G017100 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic004G258700 Sobic008G092532--Sobic007G054400 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic008G092532--Sobic010G277500 Sobic008G092532--Sobic003G101500 Sobic008G092532--Sobic010G172000 Sobic008G092532--Sobic007G225800 Sobic008G092532--Sobic007G210000 Sobic008G092532--Sobic004G107200 Sobic007G070000 Sobic007G070000 Sobic003G311600--Sobic007G070000 Sobic003G311600--Sobic008G088842 Sobic003G104100 Sobic003G104100 Sobic003G311600--Sobic003G104100 Sobic001G165801 Sobic001G165801 Sobic003G311600--Sobic001G165801 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic003G311600--Sobic006G236000 Sobic003G311600--Sobic002G340200 Sobic007G094500 Sobic007G094500 Sobic003G311600--Sobic007G094500 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic003G311600--Sobic003G135500 Sobic003G311600--Sobic002G162500
Octagon: transcription factors


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