Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G340200.2,Sobic.002G340200.1
Synonym Sb02g036463
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QEY3 , A0A1W0W6R5
Pfam -
Panther DB PTHR21669
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g37680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G070000 polyprenyl synthetase, putative, expressed K14066: geranyl diphosphate synthase
2 Sobic.008G088842 - -
3 Sobic.002G162500 - -
4 Sobic.003G311600 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
5 Sobic.010G089800 expressed protein -
6 Sobic.002G051800 BTBT2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with tetratricopeptide repeats, expressed -
7 Sobic.001G300900 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G138900 cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region family protein, expressed K11991: tRNA(adenine34) deaminase
10 Sobic.003G032600 - -
11 Sobic.009G107080 - -
12 Sobic.001G258900 - -
13 Sobic.001G541000 MYB family transcription factor, putative, expressed K11111: TERF2, telomeric repeat-binding factor 2
14 Sobic.010G262100 expressed protein -
15 Sobic.006G169500 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K01444: AGA, N4-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase
16 Sobic.003G177000 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
17 Sobic.003G341700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -
19 Sobic.008G092800 expressed protein -
20 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic007G070000 Sobic007G070000 Sobic002G340200--Sobic007G070000 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic002G340200--Sobic008G088842 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic002G340200--Sobic002G162500 Sobic003G311600 Sobic003G311600 Sobic002G340200--Sobic003G311600 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic002G340200--Sobic010G089800 Sobic002G051800 Sobic002G051800 Sobic002G340200--Sobic002G051800 Sobic001G300900 Sobic001G300900 Sobic002G340200--Sobic001G300900 Sobic007G159200 Sobic007G159200 Sobic002G340200--Sobic007G159200 Sobic010G138900 Sobic010G138900 Sobic002G340200--Sobic010G138900 Sobic007G070000--Sobic003G311600 Sobic007G070000--Sobic002G340200 Sobic010G134500 Sobic010G134500 Sobic007G070000--Sobic010G134500 Sobic007G070000--Sobic008G088842 Sobic003G223000 Sobic003G223000 Sobic007G070000--Sobic003G223000 Sobic007G070000--Sobic001G300900 Sobic010G091200 Sobic010G091200 Sobic007G070000--Sobic010G091200 Sobic004G354000 Sobic004G354000 Sobic007G070000--Sobic004G354000 Sobic006G275000 Sobic006G275000 Sobic007G070000--Sobic006G275000 Sobic008G088842--Sobic010G138900 Sobic006G140600 Sobic006G140600 Sobic008G088842--Sobic006G140600 Sobic002G143200 Sobic002G143200 Sobic008G088842--Sobic002G143200 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic008G088842--Sobic010G262100 Sobic008G088842--Sobic003G311600 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic008G088842--Sobic001G451300 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic008G088842--Sobic006G280100 Sobic006G208400 Sobic006G208400 Sobic008G088842--Sobic006G208400 Sobic008G088842--Sobic002G340200 Sobic001G258900 Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G258900 Sobic002G162500--Sobic001G300900 Sobic003G341700 Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic003G341700 Sobic002G162500--Sobic008G088842 Sobic002G162500--Sobic002G340200 Sobic004G135900 Sobic004G135900 Sobic002G162500--Sobic004G135900 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G162500--Sobic010G172000 Sobic009G107080 Sobic009G107080 Sobic002G162500--Sobic009G107080 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic002G162500--Sobic006G063001 Sobic003G311600--Sobic007G070000 Sobic003G311600--Sobic008G088842 Sobic003G104100 Sobic003G104100 Sobic003G311600--Sobic003G104100 Sobic001G165801 Sobic001G165801 Sobic003G311600--Sobic001G165801 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic003G311600--Sobic006G236000 Sobic003G311600--Sobic002G340200 Sobic007G094500 Sobic007G094500 Sobic003G311600--Sobic007G094500 Sobic003G135500 Sobic003G135500 Sobic003G311600--Sobic003G135500 Sobic003G311600--Sobic002G162500 Sobic006G080400 Sobic006G080400 Sobic010G089800--Sobic006G080400 Sobic010G205600 Sobic010G205600 Sobic010G089800--Sobic010G205600 Sobic006G036100 Sobic006G036100 Sobic010G089800--Sobic006G036100 Sobic001G453000 Sobic001G453000 Sobic010G089800--Sobic001G453000 Sobic010G089800--Sobic001G451300 Sobic001G004400 Sobic001G004400 Sobic010G089800--Sobic001G004400 Sobic010G188000 Sobic010G188000 Sobic010G089800--Sobic010G188000 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic010G089800--Sobic001G248100 Sobic006G169500 Sobic006G169500 Sobic010G089800--Sobic006G169500 Sobic003G250900 Sobic003G250900 Sobic002G051800--Sobic003G250900 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic002G051800--Sobic003G314700 Sobic002G051800--Sobic001G248100 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic002G051800--Sobic007G145400 Sobic008G135200 Sobic008G135200 Sobic002G051800--Sobic008G135200 Sobic002G412700 Sobic002G412700 Sobic002G051800--Sobic002G412700 Sobic010G139500 Sobic010G139500 Sobic002G051800--Sobic010G139500 Sobic004G336300 Sobic004G336300 Sobic002G051800--Sobic004G336300 Sobic001G437400 Sobic001G437400 Sobic002G051800--Sobic001G437400 Sobic001G300900--Sobic002G162500 Sobic001G300900--Sobic006G208400 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic001G300900--Sobic006G269800 Sobic003G361400 Sobic003G361400 Sobic001G300900--Sobic003G361400 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic001G300900--Sobic004G119400 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic007G011600 Sobic001G300900--Sobic008G088842 Sobic001G300900--Sobic003G341700 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic001G300900--Sobic008G017100 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic007G159200--Sobic008G080500 Sobic007G159200--Sobic001G248100 Sobic007G159200--Sobic006G280100 Sobic010G051400 Sobic010G051400 Sobic007G159200--Sobic010G051400 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic007G159200--Sobic004G355800 Sobic002G425200 Sobic002G425200 Sobic007G159200--Sobic002G425200 Sobic007G159200--Sobic010G262100 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic007G159200--Sobic001G300000 Sobic009G007700 Sobic009G007700 Sobic007G159200--Sobic009G007700 Sobic010G138900--Sobic008G088842 Sobic010G138900--Sobic010G262100 Sobic010G138900--Sobic001G451300 Sobic009G142000 Sobic009G142000 Sobic010G138900--Sobic009G142000 Sobic010G138900--Sobic001G453000 Sobic003G435500 Sobic003G435500 Sobic010G138900--Sobic003G435500 Sobic010G138900--Sobic003G250900 Sobic004G034700 Sobic004G034700 Sobic010G138900--Sobic004G034700 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic010G138900--Sobic002G043100
Octagon: transcription factors


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