Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G166700.1
Synonym Sb01g014580
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt C5WSA8
Pfam PF00010
Panther DB PTHR16223 PTHR16223:SF47
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G14760 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g42100.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK14164
Barley HORVU4Hr1G013720.31 , HORVU4Hr1G013720.30 , HORVU4Hr1G013720.33 , HORVU4Hr1G013720.32 , HORVU4Hr1G013720.35 , HORVU4Hr1G013720.34 , HORVU4Hr1G013720.26 , HORVU4Hr1G013720.27 , HORVU4Hr1G013720.24 , HORVU4Hr1G013720.25 , HORVU4Hr1G013720.22 , HORVU4Hr1G013720.23 , HORVU4Hr1G013720.20 , HORVU4Hr1G013720.21 , HORVU4Hr1G013720.28 , HORVU4Hr1G013720.19 , HORVU4Hr1G013720.18 , HORVU4Hr1G013720.15 , HORVU4Hr1G013720.14 , HORVU4Hr1G013720.13 , HORVU4Hr1G013720.12 , HORVU4Hr1G013720.11 , HORVU4Hr1G013720.10 , HORVU5Hr1G018100.3 , HORVU5Hr1G018100.2 , HORVU5Hr1G018100.1 , HORVU5Hr1G018100.4 , HORVU4Hr1G013720.7 , HORVU4Hr1G013720.6 , HORVU4Hr1G013720.5 , HORVU4Hr1G013720.4 , HORVU4Hr1G013720.3 , HORVU4Hr1G013720.2 , HORVU4Hr1G013720.1 , HORVU4Hr1G013720.9 , HORVU4Hr1G013720.8
Wheat TraesCS5A02G067600 , TraesCS5D02G078800 , TraesCS4A02G234500 , TraesCS5B02G074500 , TraesCS4B02G080700 , TraesCS4D02G079500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
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Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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