Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G176400.4,Sobic.003G176400.1,Sobic.003G176400.2,Sobic.003G176400.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3X4 , A0A1B6Q3W9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G060100 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
2 Sobic.001G094000 expressed protein -
3 Sobic.002G157300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K15423: serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit
4 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
5 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G079200 exonuclease, putative, expressed -
7 Sobic.008G084700 - -
8 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G178700 - -
10 Sobic.009G104201 - -
11 Sobic.003G187400 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
12 Sobic.004G031700 expressed protein -
13 Sobic.010G225226 - -
14 Sobic.005G149500 palmitoyltransferase TIP1, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
15 Sobic.001G477800 expressed protein -
16 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
17 Sobic.003G422300 recA protein, expressed K03553: recombination protein RecA
18 Sobic.005G077466 - -
19 Sobic.007G116400 - -
20 Sobic.007G011400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G176400 Sobic003G176400 Sobic006G060100 Sobic006G060100 Sobic003G176400--Sobic006G060100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic003G176400--Sobic001G094000 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic003G176400--Sobic002G157300 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic003G176400--Sobic009G040700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic003G176400--Sobic006G080300 Sobic007G079200 Sobic007G079200 Sobic003G176400--Sobic007G079200 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic003G176400--Sobic008G084700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G176400--Sobic003G268300 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G176400--Sobic007G178700 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic006G060100--Sobic003G187400 Sobic006G060100--Sobic003G268300 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic006G060100--Sobic005G149500 Sobic006G060100--Sobic003G176400 Sobic006G060100--Sobic001G094000 Sobic003G422300 Sobic003G422300 Sobic006G060100--Sobic003G422300 Sobic006G060100--Sobic006G080300 Sobic006G060100--Sobic002G157300 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic006G060100--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic002G157300--Sobic010G026400 Sobic002G157300--Sobic003G187400 Sobic002G157300--Sobic007G011400 Sobic002G157300--Sobic005G149500 Sobic002G157300--Sobic001G094000 Sobic010G260500 Sobic010G260500 Sobic002G157300--Sobic010G260500 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic002G157300--Sobic007G185900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G157300--Sobic010G263800 Sobic006G173100 Sobic006G173100 Sobic002G157300--Sobic006G173100 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic009G040700--Sobic008G078100 Sobic006G080300--Sobic003G268300 Sobic006G080300--Sobic004G031700 Sobic006G080300--Sobic001G094000 Sobic006G080300--Sobic001G477800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G080300--Sobic002G313300 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G080300--Sobic001G206100 Sobic006G080300--Sobic002G157000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic006G080300--Sobic003G170100 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G080300--Sobic001G257300 Sobic007G079200--Sobic003G176400 Sobic007G079200--Sobic001G094000 Sobic010G189000 Sobic010G189000 Sobic007G079200--Sobic010G189000 Sobic007G079200--Sobic009G040700 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic007G079200--Sobic002G158700 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic007G079200--Sobic006G046700 Sobic007G079200--Sobic004G031700 Sobic007G079200--Sobic001G477800 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic007G079200--Sobic001G296500 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic009G104201 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic008G084700--Sobic003G372700 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic008G084700--Sobic005G118600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic008G084700--Sobic004G007100 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic009G086900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic002G180666 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic008G084700--Sobic006G032500 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G084700--Sobic002G243900 Sobic003G225700 Sobic003G225700 Sobic008G084700--Sobic003G225700 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic001G420200
Octagon: transcription factors


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