Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G079200.4,Sobic.007G079200.5,Sobic.007G079200.3,Sobic.007G079200.2
Synonym Sb07g006360
Functional annotation exonuclease, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R8K5 , A0A1Z5R9P2
Pfam PF00929
Panther DB PTHR23044 PTHR23044:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15140 : Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g43080.1 : exonuclease, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT75197
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G176400 - -
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17 Sobic.001G454301 - -
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19 Sobic.002G157300 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K15423: serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit
20 Sobic.006G183800 KH domain containing protein, putative, expressed K13095: splicing factor 1


Gene co-expression network
sample Sobic007G079200 Sobic007G079200 Sobic003G176400 Sobic003G176400 Sobic007G079200--Sobic003G176400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic007G079200--Sobic001G094000 Sobic010G189000 Sobic010G189000 Sobic007G079200--Sobic010G189000 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic007G079200--Sobic009G040700 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic007G079200--Sobic002G158700 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic007G079200--Sobic006G046700 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic007G079200--Sobic004G031700 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G079200--Sobic001G477800 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic007G079200--Sobic001G296500 Sobic006G060100 Sobic006G060100 Sobic003G176400--Sobic006G060100 Sobic003G176400--Sobic001G094000 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic003G176400--Sobic002G157300 Sobic003G176400--Sobic009G040700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic003G176400--Sobic006G080300 Sobic003G176400--Sobic007G079200 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic003G176400--Sobic008G084700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G176400--Sobic003G268300 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G176400--Sobic007G178700 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic006G028200 Sobic006G028200 Sobic010G189000--Sobic006G028200 Sobic010G189000--Sobic007G079200 Sobic010G189000--Sobic001G094000 Sobic010G189000--Sobic009G040700 Sobic006G183800 Sobic006G183800 Sobic010G189000--Sobic006G183800 Sobic002G288000 Sobic002G288000 Sobic010G189000--Sobic002G288000 Sobic004G282400 Sobic004G282400 Sobic010G189000--Sobic004G282400 Sobic010G189000--Sobic006G046700 Sobic004G061900 Sobic004G061900 Sobic010G189000--Sobic004G061900 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic009G040700--Sobic008G078100 Sobic003G401000 Sobic003G401000 Sobic002G158700--Sobic003G401000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G158700--Sobic001G464200 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic001G167200 Sobic002G158700--Sobic004G031700 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic002G158700--Sobic003G445400 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic002G158700--Sobic007G000800 Sobic007G061700 Sobic007G061700 Sobic002G158700--Sobic007G061700 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic002G158700--Sobic008G149800 Sobic002G396000 Sobic002G396000 Sobic002G158700--Sobic002G396000 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic006G046700--Sobic008G153000 Sobic006G046700--Sobic004G031700 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G046700--Sobic007G026000 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G046700--Sobic001G206100 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G046700--Sobic001G306900 Sobic006G046700--Sobic003G445400 Sobic001G425000 Sobic001G425000 Sobic006G046700--Sobic001G425000 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic006G046700--Sobic001G405300 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G046700--Sobic006G013500 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic003G445400 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G477800 Sobic004G031700--Sobic006G080300 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic004G031700--Sobic006G128900 Sobic004G031700--Sobic001G094000 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic002G158700 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic004G031700 Sobic001G477800--Sobic001G094000 Sobic001G477800--Sobic001G544200 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic006G080300 Sobic001G477800--Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G477800--Sobic006G009400 Sobic001G296500--Sobic003G401000 Sobic001G296500--Sobic001G094000 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G296500--Sobic003G084900 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic001G296500--Sobic003G336800 Sobic010G166000 Sobic010G166000 Sobic001G296500--Sobic010G166000 Sobic001G296500--Sobic004G031700 Sobic001G296500--Sobic002G158700 Sobic001G514000 Sobic001G514000 Sobic001G296500--Sobic001G514000 Sobic001G296500--Sobic002G157300
Octagon: transcription factors


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