Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G046700.1
Synonym ATVPS11, VPS11, Sb06g011800
Functional annotation vacuolar protein sorting-associated protein 11, putative, expressed
UniProt C5YEB2
Pfam PF12451 PF00637
Panther DB PTHR23323 PTHR23323:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016192; vesicle-mediated transport GO:0006886intracellular protein transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G05170 : vacuolar protein sorting 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g31390.1 : vacuolar protein sorting-associated protein 11, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055873
Brachypodium KQJ82251
Barley HORVU2Hr1G069390.1 , HORVU2Hr1G069390.3 , HORVU2Hr1G069390.2
Wheat TraesCS2D02G280900 , TraesCS2B02G299300 , TraesCS2A02G282100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G046700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic006G046700--Sobic008G153000 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G046700--Sobic004G031700 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G046700--Sobic007G026000 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G046700--Sobic001G206100 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G046700--Sobic001G306900 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G046700--Sobic003G445400 Sobic001G425000 Sobic001G425000 Sobic006G046700--Sobic001G425000 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic006G046700--Sobic001G405300 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic006G046700--Sobic006G013500 Sobic006G116100 Sobic006G116100 Sobic008G153000--Sobic006G116100 Sobic008G153000--Sobic006G046700 Sobic008G149800 Sobic008G149800 Sobic008G153000--Sobic008G149800 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic008G153000--Sobic002G264200 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic008G153000--Sobic001G155000 Sobic008G153000--Sobic003G445400 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic008G153000--Sobic003G059750 Sobic008G153000--Sobic007G026000 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic008G153000--Sobic010G069100 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic009G000500 Sobic004G031700--Sobic003G445400 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic004G031700--Sobic001G544200 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic004G031700--Sobic001G477800 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic004G031700--Sobic006G080300 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic004G031700--Sobic006G128900 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic004G031700--Sobic001G094000 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic004G031700--Sobic001G511500 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic004G031700--Sobic002G158700 Sobic007G026000--Sobic008G153000 Sobic007G026000--Sobic006G046700 Sobic005G059100 Sobic005G059100 Sobic007G026000--Sobic005G059100 Sobic007G026000--Sobic003G445400 Sobic009G119000 Sobic009G119000 Sobic007G026000--Sobic009G119000 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic007G026000--Sobic002G153700 Sobic007G026000--Sobic001G206100 Sobic007G026000--Sobic006G013500 Sobic007G026000--Sobic004G031700 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic001G206100--Sobic001G257300 Sobic001G206100--Sobic006G013500 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic006G080300 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G206100--Sobic002G157000 Sobic001G206100--Sobic009G000500 Sobic004G213000 Sobic004G213000 Sobic001G206100--Sobic004G213000 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic001G206100--Sobic001G356500 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G206100--Sobic002G161000 Sobic004G138000 Sobic004G138000 Sobic001G306900--Sobic004G138000 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic001G306900--Sobic010G065300 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G306900--Sobic001G303675 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic001G306900--Sobic007G065400 Sobic001G306900--Sobic001G511500 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic001G306900--Sobic004G145500 Sobic001G306900--Sobic002G153700 Sobic001G306900--Sobic006G013500 Sobic001G306900--Sobic001G094000 Sobic003G445400--Sobic004G031700 Sobic003G445400--Sobic009G000500 Sobic008G067600 Sobic008G067600 Sobic003G445400--Sobic008G067600 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic003G307000 Sobic003G445400--Sobic002G158700 Sobic003G445400--Sobic006G128900 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic007G096000 Sobic003G445400--Sobic001G511500 Sobic003G445400--Sobic008G153000 Sobic002G197100 Sobic002G197100 Sobic001G425000--Sobic002G197100 Sobic001G176200 Sobic001G176200 Sobic001G425000--Sobic001G176200 Sobic001G425000--Sobic006G046700 Sobic001G425000--Sobic003G445400 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic001G425000--Sobic005G015900 Sobic008G152900 Sobic008G152900 Sobic001G425000--Sobic008G152900 Sobic001G202266 Sobic001G202266 Sobic001G425000--Sobic001G202266 Sobic006G186400 Sobic006G186400 Sobic001G425000--Sobic006G186400 Sobic004G180900 Sobic004G180900 Sobic001G425000--Sobic004G180900 Sobic001G405300--Sobic006G046700 Sobic001G405300--Sobic007G026000 Sobic002G159200 Sobic002G159200 Sobic001G405300--Sobic002G159200 Sobic006G161000 Sobic006G161000 Sobic001G405300--Sobic006G161000 Sobic001G405300--Sobic005G059100 Sobic007G043500 Sobic007G043500 Sobic001G405300--Sobic007G043500 Sobic001G405300--Sobic006G013500 Sobic001G405300--Sobic006G186400 Sobic001G405300--Sobic004G031700 Sobic006G013500--Sobic001G206100 Sobic006G013500--Sobic001G257300 Sobic006G013500--Sobic001G306900 Sobic006G013500--Sobic006G080300 Sobic006G013500--Sobic004G031700 Sobic006G013500--Sobic009G000500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic003G197800 Sobic006G013500--Sobic001G094000 Sobic006G013500--Sobic006G046700
Octagon: transcription factors


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