Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G072333.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1I3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22010 : replication factor C1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g36390.1 : RFC1 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 1, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G170100 - -
2 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
3 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
4 Sobic.007G116400 - -
5 Sobic.001G394400 controls maturity(PubMedID : 20585750)@"Regulation of the flowering time, PHYB"(PubMedID : 25961888)@far-red light perception and signal transduction(PubMedID : 14963106)@phytochrome B, putative, expressed K12121: phytochrome B
6 Sobic.005G110472 - -
7 Sobic.009G104300 - -
8 Sobic.001G272000 - -
9 Sobic.006G246900 expressed protein -
10 Sobic.003G390400 expressed protein -
11 Sobic.007G137900 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
12 Sobic.001G152320 - -
13 Sobic.008G116500 plus-3 domain containing protein, expressed K15178: RNA polymerase-associated protein RTF1
14 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
15 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G124001 - -
17 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G144933 - -
19 Sobic.004G112500 - -
20 Sobic.001G271900 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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