Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G192500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YT24
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G390400 expressed protein -
2 Sobic.005G110472 - -
3 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G145101 - -
5 Sobic.003G170100 - -
6 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
7 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
8 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G243900 - -
10 Sobic.006G048500 - -
11 Sobic.001G206100 expressed protein -
12 Sobic.007G167500 expressed protein -
13 Sobic.003G179201 - -
14 Sobic.005G001800 - -
15 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G096600 - -
17 Sobic.007G178700 - -
18 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
19 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
20 Sobic.002G191800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic008G192500--Sobic003G390400 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic008G192500--Sobic005G110472 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic008G192500--Sobic006G080300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic008G192500--Sobic002G145101 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic008G192500--Sobic003G170100 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic008G192500--Sobic008G173900 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic008G192500--Sobic001G257300 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic008G192500--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G192500--Sobic002G243900 Sobic003G390400--Sobic005G110472 Sobic003G390400--Sobic003G170100 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic003G390400--Sobic010G129200 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G390400--Sobic007G137900 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G390400--Sobic001G251700 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G390400--Sobic002G157000 Sobic003G390400--Sobic008G192500 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G390400--Sobic002G144933 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic003G390400--Sobic001G407200 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic006G080300--Sobic003G268300 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G080300--Sobic004G031700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G080300--Sobic001G094000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G080300--Sobic001G477800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G080300--Sobic002G313300 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic006G080300--Sobic001G206100 Sobic006G080300--Sobic002G157000 Sobic006G080300--Sobic003G170100 Sobic006G080300--Sobic001G257300 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic008G173900--Sobic002G157000 Sobic008G173900--Sobic002G144933 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic001G420200 Sobic008G173900--Sobic003G268300 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic008G173900--Sobic008G054500 Sobic008G173900--Sobic003G200200 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic008G173900--Sobic001G274200 Sobic001G413500 Sobic001G413500 Sobic008G173900--Sobic001G413500 Sobic008G173900--Sobic007G096600 Sobic001G257300--Sobic001G206100 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G257300--Sobic006G013500 Sobic001G257300--Sobic003G170100 Sobic001G257300--Sobic006G080300 Sobic001G257300--Sobic003G200200 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic001G257300--Sobic002G001600 Sobic004G213000 Sobic004G213000 Sobic001G257300--Sobic004G213000 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G257300--Sobic002G161000 Sobic001G257300--Sobic001G162300 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500
Octagon: transcription factors


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