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Transcriptome id Sobic.005G001800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPE5
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cDNA sequences
Sobic.005G001800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G170100 - -
2 Sobic.001G497200 expressed protein -
3 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
4 Sobic.003G390400 expressed protein -
5 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
6 Sobic.005G110472 - -
7 Sobic.008G192500 - -
8 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
9 Sobic.009G065100 splicing factor, putative, expressed K12850: pre-mRNA-splicing factor 38B
10 Sobic.009G104300 - -
11 Sobic.002G144933 - -
12 Sobic.007G137900 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
13 Sobic.010G202000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G020100 - -
15 Sobic.005G077400 - -
16 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
18 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
19 Sobic.009G102500 - -
20 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G001800 Sobic005G001800 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic005G001800--Sobic003G170100 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic005G001800--Sobic001G497200 Sobic002G380500 Sobic002G380500 Sobic005G001800--Sobic002G380500 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G001800--Sobic003G390400 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic005G001800--Sobic001G162300 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic005G001800--Sobic005G110472 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic005G001800--Sobic008G192500 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic005G001800--Sobic004G290800 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic005G001800--Sobic009G065100 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic001G497200--Sobic005G001800 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic001G497200--Sobic010G202000 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic001G497200--Sobic006G180432 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic001G497200--Sobic007G054000 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic001G497200--Sobic007G052900 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic001G497200--Sobic006G046000 Sobic001G497200--Sobic001G162300 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic001G497200--Sobic010G056200 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic001G497200--Sobic006G048775 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic002G380500--Sobic008G173900 Sobic002G380500--Sobic003G170100 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic002G380500--Sobic001G420200 Sobic002G380500--Sobic002G144933 Sobic002G380500--Sobic002G157000 Sobic002G380500--Sobic003G200200 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic002G380500--Sobic003G108700 Sobic002G380500--Sobic003G268300 Sobic002G380500--Sobic005G110472 Sobic003G390400--Sobic005G110472 Sobic003G390400--Sobic003G170100 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic003G390400--Sobic010G129200 Sobic003G390400--Sobic007G137900 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G390400--Sobic001G251700 Sobic003G390400--Sobic002G157000 Sobic003G390400--Sobic008G192500 Sobic003G390400--Sobic002G144933 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic003G390400--Sobic001G407200 Sobic001G162300--Sobic002G157000 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic003G268300 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G162300--Sobic007G178700 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G162300--Sobic006G082600 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G162300--Sobic007G011400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G162300--Sobic001G094000 Sobic001G162300--Sobic003G170100 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G162300--Sobic001G477800 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic008G192500--Sobic003G390400 Sobic008G192500--Sobic005G110472 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic008G192500--Sobic006G080300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic008G192500--Sobic002G145101 Sobic008G192500--Sobic003G170100 Sobic008G192500--Sobic008G173900 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic008G192500--Sobic001G257300 Sobic008G192500--Sobic003G268300 Sobic008G192500--Sobic002G243900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic004G290800--Sobic009G127900 Sobic004G290800--Sobic001G420200 Sobic004G290800--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic004G290800--Sobic007G037900 Sobic004G290800--Sobic003G268300 Sobic004G290800--Sobic001G162300 Sobic004G290800--Sobic002G157000 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic004G290800--Sobic001G111900 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic004G290800--Sobic001G446900 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic009G065100--Sobic002G320500 Sobic009G065100--Sobic002G157000 Sobic009G065100--Sobic008G173900 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic009G065100--Sobic009G215800 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic009G065100--Sobic004G084300 Sobic009G065100--Sobic002G144933 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic009G065100--Sobic002G309800 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic009G065100--Sobic001G107500 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic009G065100--Sobic003G197800
Octagon: transcription factors


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