Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G020100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0Y0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.003G020100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
2 Sobic.006G262200 - -
3 Sobic.001G111900 - -
4 Sobic.005G077400 - -
5 Sobic.002G051450 - -
6 Sobic.005G001800 - -
7 Sobic.003G107800 "thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast"(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
8 Sobic.006G191400 - -
9 Sobic.002G376900 EF hand family protein, putative -
10 Sobic.005G077466 - -
11 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
13 Sobic.006G046000 - -
14 Sobic.002G144933 - -
15 Sobic.001G454401 - -
16 Sobic.005G055150 - -
17 Sobic.009G100050 - -
18 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
19 Sobic.008G125600 - -
20 Sobic.001G303675 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic003G020100--Sobic004G290800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic003G020100--Sobic006G262200 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G020100--Sobic001G111900 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic003G020100--Sobic005G077400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic003G020100--Sobic002G051450 Sobic005G001800 Sobic005G001800 Sobic003G020100--Sobic005G001800 Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic003G020100--Sobic003G107800 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic003G020100--Sobic006G191400 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic003G020100--Sobic002G376900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic004G290800--Sobic009G127900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic004G290800--Sobic001G420200 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G290800--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic004G290800--Sobic007G037900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic004G290800--Sobic003G268300 Sobic001G162300 Sobic001G162300 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Octagon: transcription factors


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