Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G107800.1
Synonym Sb03g009060
Functional annotation "thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast" (PubMedID : 26465154)
expressed protein
UniProt C5XFL8
Pfam -
Panther DB PTHR36783
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24930 : thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g01280.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035389
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G014790.8 , HORVU3Hr1G014790.9 , HORVU3Hr1G014790.4 , HORVU3Hr1G014790.5 , HORVU3Hr1G014790.6 , HORVU3Hr1G014790.7 , HORVU3Hr1G014790.1 , HORVU3Hr1G014790.2 , HORVU3Hr1G014790.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G211800 - -
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20 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic001G211800 Sobic001G211800 Sobic003G107800--Sobic001G211800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic003G107800--Sobic002G376900 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic003G107800--Sobic002G376800 Sobic001G368400 Sobic001G368400 Sobic003G107800--Sobic001G368400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic003G107800--Sobic006G009400 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic003G107800--Sobic005G121800 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G107800--Sobic007G037900 Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic003G107800--Sobic003G020100 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic003G107800--Sobic001G479500 Sobic001G211800--Sobic003G107800 Sobic001G211800--Sobic002G376800 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic001G211800--Sobic009G004700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic001G211800--Sobic007G054000 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic001G211800--Sobic009G198900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic001G211800--Sobic003G089650 Sobic001G211800--Sobic006G009400 Sobic010G050600 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Sobic004G212800 Sobic001G479500--Sobic004G212800
Octagon: transcription factors


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