Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G211800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YH95 , A0A1B6QK32
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G107800 "thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast"(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
2 Sobic.002G376800 EF hand family protein, putative -
3 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
4 Sobic.007G054000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
5 Sobic.009G198900 trehalose synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
6 Sobic.003G089650 - -
7 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G050600 - -
9 Sobic.002G376900 EF hand family protein, putative -
10 Sobic.001G368400 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
11 Sobic.006G196000 expressed protein -
12 Sobic.001G394400 controls maturity(PubMedID : 20585750)@"Regulation of the flowering time, PHYB"(PubMedID : 25961888)@far-red light perception and signal transduction(PubMedID : 14963106)@phytochrome B, putative, expressed K12121: phytochrome B
13 Sobic.007G037900 oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold containing protein, expressed -
14 Sobic.001G479500 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K15891: NAD+-dependent farnesol dehydrogenase
15 Sobic.006G088580 - -
16 Sobic.002G077200 expressed protein -
17 Sobic.009G110366 - -
18 Sobic.005G110523 - -
19 Sobic.003G258400 splicing factor-related, putative, expressed -
20 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G211800 Sobic001G211800 Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic001G211800--Sobic003G107800 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic001G211800--Sobic002G376800 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic001G211800--Sobic009G004700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic001G211800--Sobic007G054000 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic001G211800--Sobic009G198900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic001G211800--Sobic003G089650 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G211800--Sobic006G009400 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic001G211800--Sobic010G050600 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic001G211800--Sobic002G376900 Sobic003G107800--Sobic001G211800 Sobic003G107800--Sobic002G376900 Sobic003G107800--Sobic002G376800 Sobic001G368400 Sobic001G368400 Sobic003G107800--Sobic001G368400 Sobic003G107800--Sobic006G009400 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic003G107800--Sobic005G121800 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G107800--Sobic007G037900 Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic003G107800--Sobic003G020100 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic003G107800--Sobic001G479500 Sobic002G376800--Sobic002G376900 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic002G376800--Sobic008G161401 Sobic002G376800--Sobic010G050600 Sobic002G376800--Sobic005G121800 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic002G376800--Sobic009G109450 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic002G376800--Sobic009G231300 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic002G376800--Sobic003G057800 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic002G376800--Sobic009G113600 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic002G376800--Sobic006G204200 Sobic009G004700--Sobic009G113600 Sobic009G004700--Sobic003G089650 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G004700--Sobic002G062300 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic005G110523 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G004700--Sobic007G059300 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic006G009400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic009G004700--Sobic005G212500 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G004700--Sobic003G031750 Sobic007G054000--Sobic007G037900 Sobic007G054000--Sobic001G479500 Sobic007G054000--Sobic009G198900 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic007G054000--Sobic006G246900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic007G054000--Sobic006G066650 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic007G054000--Sobic005G187200 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic007G054000--Sobic001G543800 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G054000--Sobic001G162300 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic007G054000--Sobic006G128900 Sobic003G324000 Sobic003G324000 Sobic009G198900--Sobic003G324000 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic009G198900--Sobic009G087800 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic009G198900--Sobic010G280100 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G198900--Sobic003G258400 Sobic009G198900--Sobic005G187200 Sobic009G198900--Sobic007G054000 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G198900--Sobic009G110366 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic009G198900--Sobic007G205800 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G198900--Sobic006G196000 Sobic003G089650--Sobic009G113600 Sobic003G089650--Sobic002G062300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic003G089650--SobicK024000 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic003G089650--Sobic002G056100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic003G089650--Sobic008G009500 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic003G089650--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic003G089650--Sobic001G253100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G089650--Sobic008G042250 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G089650--Sobic007G073400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic010G050600--Sobic010G146200 Sobic010G050600--Sobic009G113600 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic010G050600--Sobic003G176100 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic010G050600--Sobic005G130100 Sobic010G050600--SobicK024000 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic010G050600--Sobic008G031350 Sobic006G249000 Sobic006G249000 Sobic010G050600--Sobic006G249000 Sobic010G050600--Sobic007G059300 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic010G050600--Sobic002G108800 Sobic002G376900--Sobic002G376800 Sobic002G376900--Sobic005G121800 Sobic002G376900--Sobic010G146200 Sobic002G376900--Sobic009G113600 Sobic002G376900--Sobic009G109450 Sobic002G376900--Sobic010G050600 Sobic002G376900--Sobic009G231300 Sobic002G376900--Sobic005G130100 Sobic002G376900--Sobic003G176100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.