Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110523.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI30
Pfam PF12619
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006270; DNA replication initiation GO:0005634nucleus GO:0005524ATP binding GO:0003678DNA helicase activity GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G44900 : minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g29380.1 : MCM2 - Putative minichromosome maintenance MCM complex subunit 2, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029737
Brachypodium KQJ88539
Barley HORVU1Hr1G063700.10 , HORVU1Hr1G063700.9 , HORVU1Hr1G063700.7 , HORVU1Hr1G063700.6 , HORVU1Hr1G063700.5 , HORVU1Hr1G063700.4 , HORVU1Hr1G063700.3 , HORVU1Hr1G063700.2 , HORVU1Hr1G063700.1
Wheat TraesCS1A02G264000 , TraesCS1A02G264000 , TraesCS1D02G264100 , TraesCS1B02G274600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
2 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G005000 cysteine-rich receptor-like protein kinase 4 precursor, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
4 Sobic.001G477800 expressed protein -
5 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
6 Sobic.007G059300 - -
7 Sobic.004G169501 - -
8 Sobic.003G089650 - -
9 Sobic.009G113600 - -
10 Sobic.001G454401 - -
11 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
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13 Sobic.003G185250 - -
14 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
15 Sobic.001G454301 - -
16 Sobic.001G544200 endonuclease, putative, expressed K10848: ERCC4, DNA excision repair protein ERCC-4
17 Sobic.002G062300 expressed protein -
18 Sobic.001G094000 expressed protein -
19 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
20 Sobic.001G303675 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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