Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G169501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN07
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G04830 : Protein prenylyltransferase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g03470.1 : tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016341 , Zm00025a009013
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
2 Sobic.007G142050 - -
3 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G116400 - -
5 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
6 Sobic.003G204000 expressed protein -
7 Sobic.001G267233 - -
8 Sobic.002G181450 - -
9 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
10 Sobic.003G128600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed K09527: DnaJ homolog subfamily C member 7
11 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
12 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
13 Sobic.010G139301 - -
14 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
15 Sobic.002G073300 - -
16 Sobic.004G164600 - -
17 Sobic.008G042250 - -
18 Sobic.005G110430 - -
19 Sobic.003G435600 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G182300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic003G315332--Sobic004G169501 Sobic003G315332--Sobic007G142050 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic008G068800 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic006G129700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic003G315332--Sobic001G543900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic003G204000 Sobic003G315332--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic008G117200--Sobic010G263800 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic008G117200--Sobic008G034600 Sobic008G117200--Sobic001G094000 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic008G117200--Sobic004G088400 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G177400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic008G117200--Sobic002G421700 Sobic008G117200--Sobic007G116400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G117200--Sobic007G011400 Sobic008G117200--Sobic001G477800 Sobic003G204000--Sobic001G024200 Sobic003G204000--Sobic008G068800 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G204000--Sobic004G212800 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic004G169501 Sobic003G204000--Sobic001G543900 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic003G204000--Sobic004G112500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic003G315332 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G267233--Sobic005G117801 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G267233--Sobic005G110427 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G267233--Sobic005G110430 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic001G267233--Sobic001G253100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G267233--Sobic008G091900 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G267233--Sobic002G056100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G267233--Sobic008G042250 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G267233--Sobic008G049701 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G267233--Sobic001G240400 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G181450--Sobic002G076400 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic007G089600--Sobic001G272000 SobicK009900 SobicK009900 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic007G089600--Sobic005G001900
Octagon: transcription factors


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