Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G068800.1
Synonym
Functional annotation cytokinin inducible protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PBW4
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260:SF248 PTHR11260
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g25850.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G116400 - -
2 Sobic.007G142050 - -
3 Sobic.003G204000 expressed protein -
4 Sobic.004G169501 - -
5 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
6 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
7 Sobic.004G286900 - -
8 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G212800 - -
11 Sobic.004G164600 - -
12 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
13 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
14 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
15 Sobic.007G008800 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G118700 cbxX, chromosomal, putative, expressed -
17 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
18 Sobic.002G049000 frigida, putative, expressed -
19 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
20 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic007G116400--Sobic001G094000 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic007G116400--Sobic001G454301 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G116400--Sobic009G104300 Sobic007G116400--Sobic008G068800 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic007G116400--Sobic008G117200 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic006G080300 Sobic007G116400--Sobic004G169501 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic007G116400--Sobic001G477800 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic007G116400--Sobic009G239351 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic003G204000--Sobic001G024200 Sobic003G204000--Sobic008G068800 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G204000--Sobic004G212800 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic008G116500 Sobic003G204000--Sobic004G169501 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic003G204000--Sobic001G543900 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic003G204000--Sobic004G112500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic002G297800 Sobic003G204000--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic003G315332--Sobic004G169501 Sobic003G315332--Sobic007G142050 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic008G068800 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic001G543900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic003G204000 Sobic003G315332--Sobic007G089600 Sobic004G286900--Sobic008G068800 Sobic007G121400 Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic009G059600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G142050 Sobic004G286900--Sobic003G424100 Sobic004G286900--Sobic004G164600 Sobic004G286900--Sobic003G128600 Sobic004G286900--Sobic004G076732 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic008G068800 Sobic001G024200--Sobic004G212800 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic007G211000 Sobic001G024200--Sobic004G112500 Sobic001G024200--Sobic003G204000 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic001G272000 Sobic001G024200--Sobic004G164600 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G024200--SobicK009900 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic001G024200--Sobic001G439500 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G024200--Sobic010G248200
Octagon: transcription factors


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