Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G286900.2,Sobic.004G286900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YS74 , A0A1Z5RQJ2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G121400 YDG/SRA domain containing protein, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
3 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
4 Sobic.007G115000 - -
5 Sobic.007G142050 - -
6 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G164600 - -
8 Sobic.003G128600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed K09527: DnaJ homolog subfamily C member 7
9 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
10 Sobic.004G169501 - -
11 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
12 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G208500 - -
14 Sobic.005G110430 - -
15 Sobic.001G267233 - -
16 Sobic.007G099500 hypothetical protein -
17 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
18 Sobic.009G109101 - -
19 Sobic.007G116400 - -
20 Sobic.004G212800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic004G286900--Sobic008G068800 Sobic007G121400 Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic007G121400 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic004G286900--Sobic009G059600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G115000 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic004G286900--Sobic007G142050 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic004G286900--Sobic003G424100 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G286900--Sobic004G164600 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic004G286900--Sobic003G128600 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic004G286900--Sobic004G076732 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic007G121400--Sobic004G286900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic007G121400--Sobic010G208500 Sobic007G121400--Sobic004G076732 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic007G121400--Sobic005G212600 Sobic007G121400--Sobic004G164600 Sobic009G109101 Sobic009G109101 Sobic007G121400--Sobic009G109101 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic007G121400--Sobic001G253100 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G121400--Sobic008G031350 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G121400--Sobic008G009500 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic007G115000--Sobic005G212600 Sobic002G285200 Sobic002G285200 Sobic007G115000--Sobic002G285200 Sobic007G115000--Sobic001G253100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic007G115000--Sobic008G091900 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic007G115000--Sobic006G132200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic007G115000--Sobic002G062300 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic007G115000--Sobic004G164650 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic007G115000--Sobic008G036500 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic007G115000--Sobic005G117801 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic008G068800 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic003G128600--Sobic009G059600 Sobic003G128600--Sobic004G169501 Sobic003G015000 Sobic003G015000 Sobic003G128600--Sobic003G015000 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic003G128600--Sobic002G140800 Sobic003G128600--Sobic004G286900 Sobic009G257300 Sobic009G257300 Sobic003G128600--Sobic009G257300 Sobic003G128600--Sobic004G164600 Sobic003G128600--Sobic008G068800 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic003G128600--Sobic008G117200 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G076732--Sobic004G212800
Octagon: transcription factors


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