Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G142050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9T9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000724
Brachypodium KQK23561 , KQK23562
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
2 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
4 Sobic.004G169501 - -
5 Sobic.002G124200 expressed protein -
6 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
7 Sobic.005G001900 - -
8 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
9 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
10 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
11 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
12 Sobic.004G164600 - -
13 Sobic.008G042250 - -
14 Sobic.005G110430 - -
15 Sobic.002G076400 structural constituent of ribosome, putative, expressed -
16 Sobic.004G212800 - -
17 Sobic.002G181450 - -
18 Sobic.003G089650 - -
19 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.001G024200 lipase class 3 family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic007G089600--Sobic001G272000 SobicK009900 SobicK009900 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic007G089600--Sobic005G001900 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic003G315332--Sobic004G169501 Sobic003G315332--Sobic007G142050 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic008G068800 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic006G129700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic003G315332--Sobic001G543900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic003G204000 Sobic003G315332--Sobic007G089600 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic002G124200--Sobic007G142050 Sobic002G124200--Sobic005G001900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic004G169501 Sobic002G124200--Sobic003G315332 Sobic002G124200--Sobic002G181450 Sobic002G124200--Sobic010G263800 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic007G094801 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G124200--Sobic002G182300 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic005G001900--Sobic007G142050 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic005G001900--Sobic003G201750 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic005G001900--Sobic006G088580 Sobic005G001900--Sobic002G181450 Sobic005G001900--Sobic002G124200 Sobic005G001900--Sobic007G089600 Sobic005G001900--Sobic009G104300 Sobic005G001900--Sobic003G315332 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic005G001900--Sobic004G112500 Sobic004G076732--SobicK009900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic004G076732--Sobic002G410200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic001G253100 Sobic004G076732--Sobic008G009500 Sobic004G076732--Sobic007G073400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic009G209800 Sobic004G076732--Sobic008G042250 Sobic004G076732--Sobic005G110430 Sobic004G076732--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic004G076732
Octagon: transcription factors


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