Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G049000.1
Synonym Sb02g004090
Functional annotation frigida, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q992
Pfam PF07899
Panther DB PTHR31791 PTHR31791:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22440 : FRIGIDA-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g07680.1 : frigida, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045120 , Zm00025a016091
Brachypodium KQK20678
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G049000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic002G049000--Sobic003G346000 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic002G049000--Sobic002G297800 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic002G049000--Sobic002G090400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic002G049000--Sobic008G068800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic002G049000--Sobic007G011400 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G049000--Sobic002G061400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G049000--Sobic001G094000 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G049000--Sobic008G034600 Sobic001G394400 Sobic001G394400 Sobic002G049000--Sobic001G394400 Sobic003G346000--Sobic002G049000 Sobic003G346000--Sobic007G011400 Sobic003G346000--Sobic008G034600 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic003G346000--Sobic002G313300 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic003G346000--Sobic002G151600 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic003G346000--Sobic004G088400 Sobic007G008800 Sobic007G008800 Sobic003G346000--Sobic007G008800 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic003G346000--Sobic002G177400 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic003G346000--Sobic004G005400 Sobic002G297800--Sobic002G049000 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic002G297800--Sobic003G204000 Sobic002G297800--Sobic002G061400 Sobic002G297800--Sobic008G068800 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic002G297800--Sobic009G231300 Sobic009G257300 Sobic009G257300 Sobic002G297800--Sobic009G257300 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic002G297800--Sobic004G212800 Sobic002G297800--Sobic002G313300 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G297800--Sobic009G059600 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic002G090400--Sobic007G099500 Sobic002G090400--Sobic002G049000 Sobic002G090400--Sobic008G068800 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G090400--Sobic004G169501 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic002G090400--Sobic004G143700 Sobic002G090400--Sobic009G059600 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic002G090400--Sobic003G424100 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic002G090400--Sobic007G073400 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic002G090400--Sobic006G145000 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic007G011400--Sobic001G094000 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic007G011400--Sobic007G205800 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G011400--Sobic002G157300 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic007G011400--Sobic010G263800 Sobic007G011400--Sobic002G313300 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic007G011400--Sobic009G040700 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic007G011400--Sobic002G157000 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G011400--Sobic001G162300 Sobic007G011400--Sobic008G034600 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic002G061400--Sobic008G129700 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic002G061400--Sobic003G336800 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic002G061400--Sobic002G421700 Sobic010G199800 Sobic010G199800 Sobic002G061400--Sobic010G199800 Sobic002G061400--Sobic008G034600 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G061400--Sobic008G116500 Sobic002G061400--Sobic002G297800 Sobic002G061400--Sobic002G049000 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic002G061400--Sobic008G117200 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic008G034600--Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic010G263800 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic008G117200 Sobic008G034600--Sobic002G421700 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic008G034600--Sobic009G022200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic003G346000 Sobic001G394400--Sobic008G116500 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic001G394400--Sobic006G246900 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G394400--Sobic009G104300 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G394400--Sobic007G037900 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G394400--Sobic001G543900 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic001G394400--Sobic009G087800 Sobic001G394400--Sobic002G049000 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic001G394400--Sobic009G178800 Sobic001G394400--Sobic001G162300
Octagon: transcription factors


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