Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G196000.1
Synonym ENA, Sb06g026840
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YEY6
Pfam -
Panther DB PTHR15852
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17668 : DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010006
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G105520.11 , HORVU2Hr1G105520.10 , HORVU2Hr1G105520.9 , HORVU2Hr1G105520.8 , HORVU2Hr1G105520.7 , HORVU2Hr1G105520.6 , HORVU2Hr1G105520.5 , HORVU2Hr1G105520.4 , HORVU2Hr1G105520.3 , HORVU2Hr1G105520.2 , HORVU2Hr1G105520.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G109450 - -
2 Sobic.009G110366 - -
3 Sobic.005G130100 terpene synthase, putative, expressed K15803: (-)-germacrene D synthase
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6 Sobic.001G479500 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K15891: NAD+-dependent farnesol dehydrogenase
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8 Sobic.009G180200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
9 Sobic.009G198900 trehalose synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
10 Sobic.004G199600 DUF581 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G258400 splicing factor-related, putative, expressed -
12 Sobic.005G187200 expressed protein -
13 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
14 Sobic.002G051450 - -
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16 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
17 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G130200 - -
19 Sobic.002G376900 EF hand family protein, putative -
20 Sobic.004G020401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic006G196000--Sobic009G109450 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic006G196000--Sobic009G110366 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic006G196000--Sobic005G130100 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic006G196000--Sobic009G078500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic006G196000--Sobic003G357500 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G196000--Sobic001G479500 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic006G196000--Sobic009G231300 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic006G196000--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic006G196000--Sobic009G198900 Sobic009G109450--Sobic009G078500 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic009G180200 Sobic009G109450--Sobic005G130100 Sobic009G109450--Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic006G196000 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic009G109450--Sobic005G121800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic009G110366 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic005G130100--Sobic009G078500 Sobic005G130100--Sobic009G231300 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic005G130100--Sobic010G146200 Sobic005G130100--Sobic004G199600 Sobic005G130100--Sobic009G109450 Sobic005G130100--Sobic009G180200 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic005G130100--Sobic010G050600 Sobic005G003200 Sobic005G003200 Sobic005G130100--Sobic005G003200 Sobic006G249000 Sobic006G249000 Sobic005G130100--Sobic006G249000 Sobic009G078500--Sobic004G199600 Sobic009G078500--Sobic005G130100 Sobic009G078500--Sobic009G109450 Sobic009G078500--Sobic009G180200 Sobic009G078500--Sobic009G231300 Sobic009G078500--Sobic010G146200 Sobic001G363100 Sobic001G363100 Sobic009G078500--Sobic001G363100 Sobic009G064766 Sobic009G064766 Sobic009G078500--Sobic009G064766 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic009G078500--Sobic003G176100 Sobic003G357600 Sobic003G357600 Sobic003G357500--Sobic003G357600 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic003G357500--Sobic003G057800 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic003G357500--Sobic008G161401 Sobic003G357500--Sobic007G073400 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic003G357500--Sobic010G248200 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G357500--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic003G357500--Sobic005G130200 Sobic003G357500--Sobic006G196000 Sobic003G357500--Sobic001G479500 Sobic001G479500--Sobic003G057800 Sobic001G479500--Sobic005G130200 Sobic001G479500--Sobic010G248200 Sobic001G479500--Sobic008G161401 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic001G479500--Sobic009G156000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G479500--Sobic001G543900 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic001G479500--Sobic005G187200 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic001G479500--Sobic002G283300 Sobic001G479500--Sobic004G212800 Sobic009G231300--Sobic005G130100 Sobic009G231300--Sobic009G180200 Sobic009G231300--Sobic009G109450 Sobic009G231300--Sobic009G078500 Sobic007G156500 Sobic007G156500 Sobic009G231300--Sobic007G156500 Sobic009G231300--Sobic005G003200 Sobic009G231300--Sobic003G258400 Sobic009G231300--Sobic004G199600 Sobic009G231300--Sobic010G050600 Sobic009G180200--Sobic004G199600 Sobic009G180200--Sobic001G363100 Sobic009G180200--Sobic009G109450 Sobic009G180200--Sobic009G078500 Sobic007G023700 Sobic007G023700 Sobic009G180200--Sobic007G023700 Sobic009G180200--Sobic009G231300 Sobic009G180200--Sobic005G130100 Sobic009G180200--Sobic003G258400 Sobic009G180200--Sobic005G121800 Sobic003G324000 Sobic003G324000 Sobic009G198900--Sobic003G324000 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic009G198900--Sobic009G087800 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic009G198900--Sobic010G280100 Sobic009G198900--Sobic003G258400 Sobic009G198900--Sobic005G187200 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic009G198900--Sobic007G054000 Sobic009G198900--Sobic009G110366 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic009G198900--Sobic007G205800 Sobic009G198900--Sobic006G196000
Octagon: transcription factors


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