Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G020000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q100
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.003G020000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G104201 - -
2 Sobic.010G225226 - -
3 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
4 Sobic.004G007100 - -
5 Sobic.003G372700 expressed protein -
6 Sobic.003G087400 - -
7 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G178700 - -
9 Sobic.001G474600 calmodulin-binding transcription activator, putative, expressed -
10 Sobic.003G056100 transcription initiation factor, putative, expressed K03129: transcription initiation factor TFIID subunit 4
11 Sobic.001G272532 - -
12 Sobic.008G084700 - -
13 Sobic.005G090401 - -
14 Sobic.008G067600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
15 Sobic.004G341900 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.001G287201 - -
17 Sobic.004G204200 EMB2423, putative, expressed K11137: TELO2, telomere length regulation protein
18 Sobic.001G205200 expressed protein -
19 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
20 Sobic.003G176500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G020000 Sobic003G020000 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic003G020000--Sobic009G104201 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic003G020000--Sobic010G225226 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic003G020000--Sobic008G027000 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic003G020000--Sobic004G007100 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic003G020000--Sobic003G372700 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic003G020000--Sobic003G087400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G020000--Sobic002G006900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G020000--Sobic007G178700 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G020000--Sobic001G474600 Sobic009G104201--Sobic004G007100 Sobic009G104201--Sobic003G087400 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic009G104201--Sobic008G084700 Sobic009G104201--Sobic002G006900 Sobic009G104201--Sobic003G372700 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic009G104201--Sobic007G096600 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic009G104201--Sobic002G243900 Sobic009G104201--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic009G104201--Sobic003G268300 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic010G225226--Sobic001G272532 Sobic010G225226--Sobic009G104201 Sobic010G225226--Sobic003G020000 Sobic001G288301 Sobic001G288301 Sobic010G225226--Sobic001G288301 Sobic010G225226--Sobic007G178700 Sobic010G225226--Sobic003G087400 Sobic010G225226--Sobic004G007100 Sobic003G176400 Sobic003G176400 Sobic010G225226--Sobic003G176400 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic010G225226--Sobic002G144966 Sobic008G027000--Sobic001G272532 Sobic008G027000--Sobic003G020000 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic008G027000--Sobic002G173000 Sobic008G027000--Sobic009G104201 Sobic008G027000--Sobic010G225226 Sobic008G026900 Sobic008G026900 Sobic008G027000--Sobic008G026900 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic008G027000--Sobic005G090401 Sobic008G027000--Sobic004G007100 Sobic003G056100 Sobic003G056100 Sobic008G027000--Sobic003G056100 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic003G372700--Sobic002G006900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic003G119000 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic003G372700--Sobic007G065400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G372700--Sobic005G112300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic002G191800 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic003G372700--Sobic009G040600 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G372700--Sobic002G309600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic001G474600 Sobic003G087400--Sobic007G178700 Sobic003G087400--Sobic004G007100 Sobic003G087400--Sobic009G104201 Sobic003G087400--Sobic006G048500 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G087400--Sobic009G127900 Sobic003G087400--Sobic002G006900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G087400--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic010G056000 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G087400--Sobic001G205200 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G006900--Sobic008G047800 Sobic002G006900--Sobic007G065400 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G372700 Sobic002G006900--Sobic009G040600 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic002G309600 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G006900--Sobic001G214300 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic002G006900--Sobic001G512700 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic001G474600--Sobic003G280800 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic001G474600--Sobic009G166300 Sobic001G125200 Sobic001G125200 Sobic001G474600--Sobic001G125200 Sobic001G474600--Sobic003G372700 Sobic007G217000 Sobic007G217000 Sobic001G474600--Sobic007G217000 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic001G474600--Sobic007G096000 Sobic007G207000 Sobic007G207000 Sobic001G474600--Sobic007G207000 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic001G474600--Sobic009G191000 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic001G474600--Sobic001G241200
Octagon: transcription factors


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