Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G114400.1
Synonym BPC2, BBR/BPC2, ATBPC2, Sb02g009782
Functional annotation GAGA-binding protein, putative, expressed
UniProt -
Pfam PF06217
Panther DB PTHR31421 PTHR31421:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01930 : basic pentacysteine1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g02584.1 : GAGA-binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013327 , Zm00025a030380 , Zm00025a005221
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G064660.4 , HORVU4Hr1G064660.5 , HORVU4Hr1G064660.6 , HORVU4Hr1G064660.7 , HORVU4Hr1G064660.1 , HORVU4Hr1G064660.2 , HORVU4Hr1G064660.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G114400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic002G114400--Sobic004G010800 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic002G114400--Sobic001G262900 Sobic010G089100 Sobic010G089100 Sobic002G114400--Sobic010G089100 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic002G114400--Sobic001G239300 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic002G114400--Sobic010G056000 Sobic007G006900 Sobic007G006900 Sobic002G114400--Sobic007G006900 Sobic006G051700 Sobic006G051700 Sobic002G114400--Sobic006G051700 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic002G114400--Sobic004G152601 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic002G114400--Sobic005G043800 Sobic004G010800--Sobic004G152601 Sobic005G019200 Sobic005G019200 Sobic004G010800--Sobic005G019200 Sobic004G010800--Sobic002G114400 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic004G010800--Sobic001G489150 Sobic004G204200 Sobic004G204200 Sobic004G010800--Sobic004G204200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic004G010800--Sobic003G366850 Sobic004G010800--Sobic005G043800 Sobic003G374500 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Octagon: transcription factors


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